تجزيه و تحليل بيوانفورماتيكي توالي‌هاي EST گل شاخه بريده ژربرا (Gerbera hybrid) به‌منظور شناسايي ژن‌هاي دخيل در مقاومت به بيماري بوتريتيس

تنش هاي زيستي از جمله بيماري بوترتيس از موانع اصلي در توليد گل ژربرا مي باشند. اين تحقيق به‌منظور شناسايي ژن هاي دخيل در مقاومت به بيماري بوترتيس به كمك تجزيه و تحليل اطلاعات EST كتابخانه گل ژربرا انجام شد. اطلاعات اوليه كتابخانه گل ژربرا شامل 1920 EST از بانك اطلاعاتي NCBI جمع آوري شدند. پس از پيرايش اوليه، توالي هاي EST دسته‌بندي و يكپارچه شدند كه منتج به ايجاد 1139 ژن واحد (361 توالي همپوشان و 778 توالي منفرد) شد. نتايج جستجوي بلاست X نشان داد كه 688 ژن واحد داراي hit مشخص در بين پروتئين هاي آرابيدوپسيس بودند و براي ساير توالي ها hit مشخصي شناسايي نشد. گروه بندي و آناليز غني‌سازي ژني، توالي هاي EST كتابخانه ژربرا را بر اساس كاركرد مولكولي، نوع پروتئين و اجزاي سلولي به‌ترتيب در 10 ، 25 و 6 گروه كاركردي مختلف قرار داد كه حضور 6 گروه در سطح آماري يك درصد معني دار شد. شبكه ژني مربوط به توالي هاي با حضور بالا نشان داد كه ژن هاي مربوط به فاكتورهاي رونويسي خانواده MYB (MYB73، ATMYB21 و RHC1A) كه به شدت تحت تأثير مسير جاسمونيك اسيد بودند، ژن هاي رمزكننده آنزيم هاي آنتي اكسيدانت، ژن‌هاي دخيل در فرآيند انتقال پيام كلسيم (مثل ژن كلمودولين (CAM7 و خانواده پروتئيني UBQ سهم بزرگي از شبكه تنظيمي را به خود اختصاص مي‌دهند و نقش كليدي در مقاومت به بيماري بوتريتيس برعهده دارند. ژن هاي شناسايي شده در اين مطالعه مي توانند نامزدهاي مناسبي براي دست ورزي مقاومت به بيماري بوتريتيس در گل ژربرا باشند.