عنوان مقاله :
توالي‌يابي و تجزيه بيوانفورماتيكي قسمتي از راه انداز ژن بتاكازئين در شترهاي تك‌كوهان و دو‌كوهان ايران
پديد آورندگان :
محمدي ، الياس دانشگاه فردوسي مشهد , طهمورث پور ، مجتبي دانشگاه فردوسي مشهد , نصيري ، محمدرضا دانشگاه فردوسي مشهد , سخاوتي ، محمدهادي دانشگاه فردوسي مشهد , ساعدي ، نغمه دانشگاه آزاد اسلامي واحد علوم و تحقيقات
كليدواژه :
توالي‌يابي , تفاوت‌هاي تك‌نوكلئوتيدي , شتر تك‌كوهان , شتر دو‌كوهان , هاپلوتايپ
چكيده فارسي :
كازئين مهم‌ترين بخش پروتئين شير است. ژن‌هاي كازئين و تنظيم بيان آن‌ها به خاطر اهميت اقتصادي‌شان موضوع تحقيقات وسيع بوده‌اند. پيدا كردن عناصر تنظيمي مهم و آلل‌هاي چندشكل خاص در ناحيه راه‌انداز ژن‌هاي كازئين پايه خوبي براي انتخاب بر اساس ماركر ايجاد مي‌كند. هدف از اين مطالعه توالي‌يابي، آناليز بيوانفورماتيكي و بررسي موتيف‌هاي قسمتي از راه‌انداز ژن بتاكازئين در شترهاي تك‌كوهان و دو‌كوهان ايران و هم‌چنين بررسي تفاوت‌هاي تك‌نوكلئوتيدي (SNPs) در گونه شتر تك‌كوهان و دو‌كوهان ايران بود. تعداد 10 عدد نمونه خون شتر نر و ماده تك‌كوهان از كشتارگاه مشهد و تعداد پنج عدد نمونه خون شتر نر و ماده دو‌كوهان از ايستگاه تحقيقات منابع طبيعي و امور دام استان اردبيل تهيه شد. پس از استخراج DNA، واكنش زنجيره‌اي پليمراز توسط آغازگرهاي اختصاصي انجام شد و نمونه‌ها جهت توالي‌يابي به شركت بايونير ارسال شدند. توالي‌هاي مورد توافق براي شترهاي تك‌كوهان و دو‌كوهان به‌دست آمد و بررسي موتيف‌ها، تجزيه و تحليل تبارزايي و هاپلوتايپ‌ها انجام شد. بر اساس مقايسه توالي‌هاي به‌دست آمده با توالي‌هاي ثبت شده در پايگاه اطلاعاتي NCBI (بخشي از كل توالي)، مشخص شد كه ناحيه مورد مطالعه، با وجود هاپلوتايپ‌هاي متفاوت، جهشي را نشان نمي‌دهد. بررسي‌ها هشت نوع هاپلوتايپ را در شترهاي تك‌كوهان و پنج نوع هاپلوتايپ را در شترهاي دو‌كوهان نشان داد.
