عنوان مقاله :
بررسي ميزان بيانPdu-miR477 و Pdu-miR398و ژن‌هاي هدف آن‌ها تحت تنش سرما در بادام
پديد آورندگان :
غضنفري ، فرحناز دانشگاه شهركرد - دانشكده كشاورزي - گروه اصلاح نباتات و بيوتكنولوژي , ربيعي ، محمد دانشگاه شهركرد - دانشكده كشاورزي - گروه اصلاح نباتات و بيوتكنولوژي , شيران ، بهروز دانشگاه شهركرد - دانشكده كشاورزي - گروه اصلاح نباتات و بيوتكنولوژي
كليدواژه :
بادام , تنش سرما , ميكرو RNA , qPCR , 5ʹRLM , RACE
چكيده فارسي :
بادام (Prunus dulcis Mill.) به‌عنوان گياه خشكباري مهم جهت نمو جوانه‌هاي ميوه به سرماي زمستان نياز دارد ولي يخ زدگي در آخر زمستان و ابتداي بهار منجر به صدمه به بافت‌هاي زايشي در اين گياه و در نتيجه كاهش ميزان باروري مي‌شود. تنش‌هاي غيرزيستي از جمله تنش سرما از طريق تغيير الگوي بيان ژن نمو و توليد گياهان را تحت تاثير قرار مي‌دهد. از آنجايي‌كه miRNAها نقش مهمي در تنظيم پاسخ به تنش از طريق تاثير متقابل بر mRNAهاي هدفشان دارند، در اين مطالعه براي اولين‌بار بيان دو miRNA با توالي حفاظت شده در گياهان مختلف و مرتبط با ايجاد تحمل به سرما، Pdu-miR398b و Pdu-miR477a-3p، در بادام بررسي شد. در اين تحقيق بررسي بيان در بافت‌هاي زايشي بساك و تخمدان بادام تحت تيمارهاي سرمايي صفر و 2- درجه سانتي‌گراد در رقم حساس به سرما Sh12 و ژنوتيپ متحمل به سرماي H صورت گرفت. بيان Pdu-miR398b و Pdu-miR477a-3p تحت تيمار سرمايي 2- درجه سانتي‌گراد در بافت‌هاي بساك و تخمدان رقم حساس به سرما Sh12 افزايش بيان داشت، در حالي‌‌كه آن‌ها در بافت بساك ژنوتيپ متحمل به سرما H كاهش بيان داشتند. ژن هاي هدف miRNAهاي موردنظر با ابزارهاي بيوانفورماتيكي پيشگويي شدند. يك همبستگي منفي بينPdu-miR398b و ژن هدف پيش‌بيني شده آنPduDUF1639 در ژنوتيپSh12 تحت هر دو تيمار تنش سرمايي مشاهده شد. هم‌چنين كاهش بيان Pdu-miR477a-3p در ژنوتيپ متحمل به سرما با افزايش بيان ژن‌هاي هدف پيش‌بيني شده آن، PduAAE7 و ABC transporter همراه بود. بيان متفاوت Pdu-miR398bو Pdu-miR477a-3p و ژن‌هاي هدف پيش‌بيني شده آن‌ها در رقم‌هاي حساس و متحمل به سرماي بادام مي‌تواند به‌عنوان دليلي بر دخيل بودن آن‌ها در پاسخ به تنش سرما در اين گياه باشد.
