ارزيابي ژنومي تك‌مرحله‌اي (Single Step GBLUP): مطالعه موردي در ارزيابي ژنومي گاو گوشتي

روش تك مرحله‌اي (SS-GBLUP) انتخاب ژنومي در مقايسه با روش چند‌مرحله‌اي، با توجه به ادغام ماتريس خويشاوندي روابط ژنومي آللي و ماتريس خويشاوندي شجره‌اي و استفاده هم‌زمان تمام حيوانات ژنوتيپ شده و نشده در مدل‌هاي ژنومي اخيراً كاربرد وسيعي در برآورد ارزش‌هاي اصلاحي ژنومي ايفا كرده است. هدف از مطالعه اخير مقايسه تفاوت صحت ارزيابي ژنومي براي روش‌هاي BLUP سنتي، G-BLUP، SNP-BLUP و SS-GBLUP براي صفت وزن لاشه در گاو گوشتي بود. نتايج اين مطالعه نشان داد كه متوسط صحت پيش‌بيني ژنومي روش‌هاي فوق به‌ترتيب برابر با 0.11±0.77، 0.21±0.88، 0.23±0.87 و 0.25± 0.95 برآورد شد. صحت پيش‌بيني ژنومي در روش SS-GBLUP نسبت به روش‌هاي BLUP سنتي، G-BLUP و SNP-BLUP به‌ترتيب 0.18، 0.07 و 0.08 بيش‌تر برآورد شد. ميانگين مربعات خطاي پيش‌بيني براي روش‌هاي فوق به‌ترتيب 3.46، 2.21، 2.22 و 1.76 به‌دست آمد. روش SS-GBLUP با توجه به پايين بودن ميانگين مربعات خطا و بالا بودن صحت پيش‌بيني ژنومي روش مطلوب‌تري بود. ضرايب رگرسيون پيش‌بيني ژنومي براي روش‌هاي SNP-BLUP، G- BLUP و SS-GBLUP به‌ترتيب 0.81، 0.82 و 0.90 به‌دست آمد و بنابراين اريب برآوردها در SS-GBLUP نسبت به دو روش‌ ديگر كمتر است.