بررسي و تحليل فيلوژنتيكي ناحيه COXI در برخي از نژادهاي بز ايراني

DNA ميتوكندريايي يكي از گسترده‌ترين نشانگرهاي مولكولي براي مطالعات فيلوژنتيك در حيوانات به علت ساختار ژنوم ساده آن است.اين مطالعه ويژگي‌هاي ژنتيكي بزهاي بومي را با استفاده از تجزيه و تحليل توالي ( DNA Cytocrome oxidase I (COXI  براي شناسايي و تمايز بين سه نژاد (نجدي، عدني و مرخز) ايران بررسي مي‌كند. استخراج DNA با استفاده از روش بهينه شده نمكي انجام شد و ژن سيتوكروم اكسيداز I به روش PCR با يك جفت پرايمر، تكثير گرديد. درخت فيلوژنتيكي با استفاده از نرم افزار 6 Mega به‌دست آمد. توالي  COXI از 60 بز داراي تنوع هاپلوتيپي 0/47 و تنوع نوكلئوتيدي 0/0005 بود. تجزيه و تحليل ها به كمك رويه Composition برنامه BioEdit نشان داد اين توالي براي ناحيه COXI شامل 28/97 درصد نوكلئوتيد A و 25/52 درصد نوكلئوتيد C و 15/86 درصد نوكلئوتيد G و 66/29 درصد نوكلئوتيد T مي‌باشد كه نسبت C+G، چهل و دو درصد و A+T، پنجاه و هشت درصد است. ارتباط تكاملي به وسيله درخت فيلوژنتيك نمايش داده شد.درخت فيلوژني نشان داد كه بزهاي ايراني در يك شاخه جداگانه خوشه‌بندي شده است. اين نتيجه به طور گسترده از توزيع جغرافيايي اين نژاد‌ها در ايران پيروي مي كند و مي تواند در طراحي برنامه‌هاي حفاظت و مديريت نژادهاي بز ايراني مورد استفاده قرار گيرد.