پديد آورندگان :
سخن سنج، يلدا دانشگاه آزاد اسلامي، تهران - واحد علوم و تحقيقات - گروه گياه پزشكي , بنانج، كاوه سازمان تحقيقات، آموزش و ترويج كشاورزي، تهران - موسسه تحقيقات گياه پزشكي كشور - بخش تحقيقات ويروس شناسي گياهي , رخشنده رو، فرشاد دانشگاه آزاد اسلامي، تهران - واحد علوم و تحقيقات - گروه گياه پزشكي , آهون منش، علي موسسه آموزش عالي صنعتي فولاد - فولادشهر، اصفهان
چكيده فارسي :
ويروس كوتولگي سبزرد نخود (Chickpea chlorotic dwarf virus, CpCDV) از جنس Mastrevirus، تيره Geminiviridae، از مهمترين عوامل ويروسي همراه با عارضه زردي نخود مي‌باشد. در سال هاي 1395-1394 تعداد 248 نمونه نخود و عدس با نشانه زردي از پنج استان لــرستان، كــرمانشاه، زنجــان، آذربايجان شرقي و غربي انتخاب و از طريق آزمون TBIA و PCR بررسي شدند. استخراج دياناي از نمونه هاي آلوده انجام و از طريق روش دايره غلطان (RCA) تغليظ و پس از هضم آنزيمي محصول (RCA) با استفاده از آنزيم برشي Xho I ، قطعات با اندازه حدود 6/2 كيلو جفت باز روي ژل آگاروز مشاهده شد. با استفاده از جفت آغازگر اختصاصي و انجام PCR، قطعه 960 جفت بازي تكثير و پس از همسانه‌سازي، تعيين ترادف گرديد. نتايج آزمون TBIA و PCR نشان‌دهنده پراكنش ويروس CpCDV در هر پنج استان بود. بيشترين ميزان آلودگي در ميزبان نخود مشاهده شد. مقايسه ترادف قطعه ژنومي جدايه هاي ايراني CpCDV نشانگر بيشترين يكساني با سويه A، D و F از كشورهاي هند، پاكستان و يمن بود. آناليز تبارزائي نشانگر هم گروهي جدايههاي ايراني با سويه‌هاي D (جدايه هاي سودان، مراكش، هند و پاكستان (گروه III تبارزائي)، سويه F (جدايه هاي سودان، عمان، سوريه، يمن و پاكستان (گروه IV تبارزائي) و سويه A (جدايههاي تونس، مصر، سوريه و تــركيه (گروه V تبارزائي ) بود.
چكيده لاتين :
Chickpea chlorotic dwarf virus (CpCDV, genus Mastrevirus, family Geminiviridae) is one of the most important viral agents which associated with yellowing symptom in the chickpea fields. During the surveys, 2015-2016, 248 chickpea and lentil plant samples showing yellowing symptom were collected from five provinces: Lorestan, Kermanshah, Zanjan, East and West Azarbaijan, in Iran. The samples were tested to CpCDV infection, using TBIA and positive samples in TBIA were tested by PCR. Total DNA of positive samples were extracted and enriched using rolling-circle amplification (RCA). RCA products were restricted using Xho I enzyme and yielding products of ~2.5-6 kb. These fragments were used for polymerase chain reaction (PCR), using specific primers for RepA protein of CpCDV. PCR amplicons with an expected size of ~960 bp were amplified, cloned and sequenced.TBIA and PCR results showed the presence of CpCDV infection in all surveyed provinces with the highest infection in chickpea plants. Nucleotide sequence comparisons showed that Iranian isolates shared the highest identity to strain A, D and F from India, Pakistan, and Yemen. Phylogenetic anlyses showed that Iranian CpCDV strains were grouped with Sudan, Morrocco, India, and Pakistan (strain D, group III), Sudan, Oman, Yemen, and Pakistan (starin F, GroupIV), and Tunesia, Egypt, Syria, and Turkey (strain A, group V).
