تعيين خصوصيات فنوتيپي و تنوع ژنتيكي جدايه‌هاي Pseudomonas syringae pv. syringae عامل شانكر باكتريايي درختان ميوه هسته‌دار در استان‌هاي خراسان رضوي و شمالي

Determination of Phenotypic Properties and Genetic Diversity of Pseudomonas syringae pv. syringae Strains Causing Bacterial Canker in Stone Fruits in Razavi and Northern Khorasan Provinces

باكتري( Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss عامل يكي از بيماري‌هاي شايع در باغ‌هاي درختان ميوه هسته‌دار مي‌باشد. به منظور شناسايي جدايه‌هاي عامل بيماري، طي سال‌هاي 1391-1390، 23 جدايه به‌دست آمده از باغ‌هاي درختان ميوه هسته‌دار واقع در مناطق مختلف استان‌هاي خراسان رضوي و شمالي از نظر فنوتيپي (فيزيولوژيكي و بيوشيميايي) و بيماري‌زايي مورد بررسي قرار گرفتند. جدايه‌ها از نظر ويژگي‌هاي فنوتيپي اختلافات جزئي نشان دادند. همه جدايه‌ها روي هلو و بادام داراي قدرت بيماري‌زايي بالايي بودند و از اين نظر مشابه به نظر رسيدند. صحت تشخيص جدايه‌ها در سطح گونه توسط واكنش زنجيره‌اي پليمراز و با استفاده از آغازگر‌هاي D21/D22 اختصاصي گونه مورد تاييد قرار گرفت. تنوع ژنتيكي جدايه‌ها به دو روشrepetitive element palindromic PCR (rep-PCR) و با استفاده از آغازگر‌هاي BOXA1R، ERIC1R و ERIC2 و روش Insertion Sequence PCR (IS-PCR) و با استفاده از آغازگر IS50 مورد بررسي قرار گرفت. آناليز خوشه‌اي نتايج به دست آمده نشان داد كه در BOX-PCR با آغازگر BOXA1Rدر سطح تشابه 75 درصد، جدايه‌ها به 7 گروه؛ در ERIC-PCR با آغازگر ERIC1R در سطح تشابه 65 درصد، جدايه‌ها به 7 گروه و با آغازگر ERIC2 در سطح تشابه 56 درصد، جدايه‌ها به 8 گروه؛ در IS-PCR با آغازگر‌IS50 در سطح تشابه 52 درصد، جدايه‌ها به 11 گروه و در نهايت با تركيب هر چهار آغازگر‌ در سطح تشابه 54 درصد جدايه‌ها به 7 گروه قابل تفكيك هستند. نتايج بيانگر تنوع ژنتيكي بالا درون جدايه‌هاي عامل بيماري شانكر باكتريايي درختان ميوه هسته‌دار در استان‌هاي مورد مطالعه است.

Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) is the causative agent of the bacterial common diseases in stone fruit trees fields. In this research, samples were collected from various areas in Razavi and Northern Khorasan provinces. A total of 23 bacterial isolates were compared based on their phenotypic (physiological and biochemical) characteristics and pathogenicity tests. Identification of the strains was further confirmed by PCR using D21/D22 primers specific to P. syringae. Genetic diversity of selected strains was investigated by repetitive element palindromic PCR (rep-PCR) fingerprinting using BOXA1R, ERIC1R, ERIC2 primers and Insertion Sequence PCR (IS-PCR) fingerprinting using IS50 primers. The cluster analyses of the fingerprint data showed that in BOX-PCR with BOXA1R primer, 7 groups were developed at a similarity level of 75%. The same numbers of groups were obtained in ERIC-PCR using ERIC1R primer at a similarity level of 65%. In case of ERIC2 primer, at a similarity level of 56%, strains were divided into 8 groups, whereas, in IS-PCR with IS50 primer at a similarity level of 52%, strains were divided into 11 groups and finally by combining all four primers at a similarity level of 54%, strains can be distinguished into 7 groups. The results demonstrated the existence of a considerable genetic diversity among Pss strains causing bacterial canker in stone fruit trees in the studied provinces.