شبيه سازي ديناميك مولكولي برهمكنش داروي ضد سرطان پاكليتاكسل با غشاي سلولي: بررسي تغييرات انرژي واندروالسي و فاصله مركز جرم

به دليل افزايش روزافزون سرطان و توليد داروي جديد در درمان آن در اين تحقيق به بررسي برهمكنش داروي جديد ضد سرطان آبگريز پاكليتاكسل بر روي غشاي سلولي با استفاده از ابزارهاي محاسباتي پرداخته شده است. از نرم افزار ديناميك مولكولي NAMD و همچنين، نرم افزار VMD براي آماده سازي فايل هاي ورودي كه از بانك داده هاي پروتيين گرفته شده بودند˛ جهت شبيه سازي و همچنين تحليل و بررسي داده هاي خروجي استفاده شده است. شبيه سازي با استفاده از كنترل كننده هاي دما و فشار در دماي 310 كلوين بدن و فشار 1 بار در مدت 10 نانو ثانيه انجام گرفته است. معادلات حاكم بر محاسبات˛ معادلات حركت نيوتني و پتانسيل استفاده شده در آن پتانسيل لنارد –جونز مي باشد. برهمكنش داروي پاكليتاكسل با غشاي سلولي از نظر انرژي واندروالسي و فاصله مركز جرم مورد بررسي قرار گرفته است كه نتايج حاصل از آن نشان دهنده پايداري و جذب نسبتا پايين پاكليتاكسل به غشاي سلولي مي باشد. نتايج محاسباتي اين پژوهش تائيد كننده صحت مطالعات آزمايشگاهي محققان پيشين بوده است. اين دارو بنا به خواص آبگريزي خود پايداري و جذب پاييني به غشاي سلولي از خود نشان داده است. بنابراين مصرف و تجويز اين داروي ضد سرطان به روشهاي نوين دارورساني مي تواند بسيار موثرتر و كارامدتر باشد.