بررسي تنوع ژنتيكي جمعيت‌هاي بابونه آلماني كشت شده در ايران با استفاده از نشانگر SCoT

Evaluation of genetic diversity among Iranian chamomilla Matricaria using Scot Markers

بابونه آلماني با نام علمي (chamomilla Matricaria) گياهي علفي، يكساله از تيره كاسني است. بابونه از ديرباز عمدتا به منظور استفاده از اسانس و عصاره آن در صنايع دارويي ،آرايشي و بهداشتي، عطرسازي و چاشني هاي غذايي به عنوان ستاره اي در ميان گياهان دارويي مطرح بوده است. مطالعه حاضر با هدف بررسي تنوع ژنتيكي در نه جمعيت بابونه آلماني با استفاده از نشانگر ملكولي SCoT انجام شد. ده آغازگر SCoT مورد استفاده قرار گرفت، آغازگرها نوارهاي چندشكل با الگوي نواري واضح ايجاد كردند. در مجموع 141 نوار ايجاد شد كه از اين بين 140 نوار (5/96 درصد) چندشكلي نشان دادند. تجزيه خوشه‌اي با استفاده از الگوريتم UPGMA و بر اساس ضريب تشابه جاكارد انجام شد، نتايج حاصل از تجزيه خوشه‌اي و تجزيه به مولفه‌هاي اصلي توانست نمونه‌هاي جمعيتي بابونه را به چهار گروه تقسيم نمايد. نتايج حاصل از تجزيه واريانس مولكولي (AMOVA) نشان داد ميزان تنوع بين گروهي بيشتر از تنوع درون گروهي است به طوري كه 55 درصد تنوع مربوط به تنوع بين گروه‌ها بود. نتايج اين پژوهش نشان داد نشانگرهاي SCoT در تعيين ميزان تنوع ژنتيكي و روابط خويشاوندي نمونه‌هاي جمعيتي مورد مطالعه بابونه از كارايي بالايي برخوردار هستند.

German chamomile (Matricaria chamomilla L.) is an s an annual plant of the composite family Asteraceae. This plant is native to the Mediterranean region, and some researchers have reported its origins in Asia. The aim of this study was to investigate the genetic diversity of nine chamomile populations using the SCoT marker. Ten SCoT primers were used. A total of 141 bands were produced, of which 140 bands (96.5%) showed polymorphism. Cluster analysis was performed using UPGMA algorithm based on Jaccard's coefficient of similarity. The results of cluster analysis and principal components analysis divided the chamomile population into four groups. The results of the analysis of molecular variance (AMOVA) showed that the inter-group variation was greater than the intra-group variation, so that 55% of variation was related to the diversity among the groups. The results of this study showed that SCoT markers have high efficiency in determining the genetic diversity and relationships of the chamomile populations.