بررسي ساختار ژنتيكي و اصالت اسب كرد با استفاده از دوازده نشانگر ميكروستلايت

Genetic structure and assignment tests of Kurdish horse based on microsatellite markers

با پيشرفت تكنيك هاي ژنتيك مولكولي، امروزه تعيين نسب در موجودات و بررسي روند تكاملي آنها امكان پذير است. در اين تحقيق تنوع ژنتيكي و انتساب اسب هاي نژاد كرد به جمعيت مبدا يا جمعيت هايي از اسب عرب و تركمن با استفاده از 12 نشانگر ريزماهواره توصيه شده توسط انجمن جهاني ژنتيك حيواني (ISAG) مورد ارزيابي قرار گرفت. براي اين منظور از 238 راس اسب كرد، 36 راس اسب عرب و 30 راس اسب تركمن در مناطق پراكنش آن ها خون گيري انجام شد. از نمونه هاي خون گرفته شده DNA به روش نمكي بهينه يافته استخراج شد. DNA به وسيله واكنش PCR چندگانه با استفاده از آغازگرهاي نشان دار تكثير و آلل هاي هر نشانگر توسط الكتروفورز مويين تعيين شد. ميانگين تعداد آلل مشاهده شده و موثر براي تمام نشانگرها به ترتيب برابر با 9/50 و 4/71 محاسبه شد. بيشترين و كمترين هتروزيگوسيتي مورد انتظار به ترتيب در نشانگرهاي (ASB17 (0.83) and HTG4 (0.71 به دست آمد. تجزيه خوشه اي به روش UPGMA و ضريب Dice، افراد هر نژاد را به صورت كاملا مجزا از هم تفكيك كرد. نتيجه آزمون انتساب بهوش بيزي نشان داد كه نشانگرهاي استفاده شده تمام افراد را به درستي به جمعيت مبداء منتسب نمود، بنابراين به نظر مي رسد مي توان از اين نشانگرها با دقت بسيار زياد در تفكيك افراد اين نژادها از هم استفاده كرد. در مجموع نتايج حاصل از اين تحقيق نشان داد كه نشانگرهاي ريزماهواره استفاده شده تنوع ژنتيكي بالايي بين كليه افراد مورد مطالعه دارند، از اين رو استفاده از اين نشانگرها براي آزمون هاي انساب و انتساب اسب هاي كرد توصيه مي شود، به طوري كه مي توان از اين نشانگرها در راستاي شتاخت و تعيين اصالت در اسب هاي نژادي كردي بهره جست و اسب هاي ناخالص را از روند توليد مثلي حذف نمود.

As the progress of molecular genetics techniques, it is now possible to determine the relationship between individuals and their evolutionary process. In this study, the genetic structure and assignment test of Kurdish horses breed to its origin or Arab and Turkmen horses breed were investigated using 12 microsatellite markers recommended by the International Society for Animal Genetics (ISAG). For this purpose, blood samples from 238 Kurd, 36 Arab and 30 Turkmen horses were taken in their distribution areas. DNA was extracted from Blood samples by the salting-out method. DNA fragments were amplified by multiplex PCR reaction using fluorescently labeled primers and determined by capillary electrophoresis. The mean of observed and effective alleles for all markers was 9.9 and 4.71, respectively. The highest and lowest expected heterozygosity was obtained for ASB17 (0.83) and HTG4 (0.71) markers, respectively. Cluster analysis using the UPGMA method and the Dice coefficient differentiated each breed. The result of the Bayesian Assignment test showed that all individuals correctly assigned to its population, so it seems that these markers are useful for the assignment test. Overall, the results of this study showed that the microsatellite markers used in this study showed high genetic diversity, so the use of these markers for genetic diversity study and assignment test of the Kurdish horse is recommended. So, these markers can be used to determine the exact origin of the Kurdish horse breed and eliminated the non-purebred horses from the reproductive process.