عنوان مقاله :
بررسي بيان افتراقي ژن ها، مسيرها و شبكه ژني در بافت عضله جنين گوسفند در دو نژاد دنبه دار و بي دنبه
پديد آورندگان :
محمدي، فهيمه دانشگاه فردوسي، مشهد , طهمورث پور، مجتبي دانشگاه فردوسي، مشهد , جوادمنش، علي دانشگاه فردوسي، مشهد
كليدواژه :
ماهيتشناسي , متابوليسم ليپيد , ميوفيبريل , ميوژنز , Cytoscape
چكيده فارسي :
فرآيندهاي رشد عضلات و متابوليسم ليپيد كه نقش مهمي در مراحل رشد و نمو جنين دارند،در گوسفندان بي-دنبه و دنبهدار متفاوت است.از اينرو براي درك بهتر ژنهاي افتراقي و مسيرهاي آنها در بافت عضله قبل از تولد، دادههاي بيان ژن حاصل از آزمايش آرايه مربوط به بافت عضله دو نژاد گوسفند دنبهدار و بيدنبه (Access number: GSE23563) مورد تجزيه و تحليل قرار گرفت. در مراحل 70، 85، 100، 120 و 135 روزگي جنيني بترتيب 691، 410، 404، 290 و 155 ژن داراي بيان افتراقي با استفاده از بسته نرمافزاري LIMMA در محيط R شناسايي شد. همچنين شناسايي خوشههاي ژني معنيدار با استفاده از Cytoscape براي هر مقطع سني انجام شد. در نهايت 12 ژن افتراقي در مجموع پنج مرحله جنيني معرفي شد كه در ميان آنها ژنهاي EEF1A2، SELI، ITGAM، NINL و RPL39 بهعنوان ژنهاي مرتبط با وزن جنين، درگير در رشد و نمو عضلات جنيني و تنظيم متابوليسم اسيدهاي چرب شناسايي شد.همچنين آناليز ماهيتشناسي ژنهاي افتراقي توسط DAVID منجر به شناسايي فرآيندها و مسيرهاي معنيدار مرتبط با ميوژنز، متابوليسم چربي و سيستم ايمني و عصبي در ترانسكريپتوم عضلات در حال رشد شد. نتايج اين بررسي ميتواند اطلاعات تكميلي از تاثير قابلتوجه ژنها بر تشكيل بافت عضله و چربي در مراحل رشد و نمو جنيني و مسيرهاي درگير در اين فرآيندهاي بيولوژيكي را فرآهم آورد. همچنين اين ژنها ممكن است شواهدي براي نشانگرهاي مولكولي مرتبط با برخي صفات اقتصادي مانند وزن تولد، صفات لاشه و كيفيت گوشت در گوسفند فراهم آورد كه ميتواند در برنامههاي اصلاحي به كار رود.
چكيده لاتين :
اين مقاله فاقد چكيده لاتين است
عنوان نشريه :
علوم دامي (پژوهش و سازندگي)