Cloning and Expression of Bst DNA Polymerase I Gene in E. coli BL21

Introduction: DNA polymerases, in addition to being indispensable in replication and repair, are also very useful in a number of molecular biology techniques such as DNA amplification, site-directed mutagenesis, DNA sequencing, different kinds of PCR, loop-mediated isothermal amplification (LAMP), etc. After the invention of PCR, efforts have been made to focus on the identification and isolation of thermo-tolerant enzymes that amplify DNA efficiently at high temperatures. Materials and methods: In this study, Geobacillus stearothermophilus strain10 was selected for the cloning of Bst DNA Pol I - encoding gene. Following DNA extraction from the bacterium, PCR was carried out to amplify the pol A gene using designed primers and to clone via pET32a expression vector followed by transfer to the heterologous E.coli BL21 host. The cloned gene was expressed by induction with IPTG and the resultant protein purified by IMAC column. Results: The activity of the functional fragment was assessed by LAMP and showed a relatively high DNA amplification ability in comparison with commercial Bst DNA Polymerase which is usually used in this amplification protocol. Discussion and conclusion: This study found thatKlenow fragment of recombinant Bst DNA Pol I can amplify uidA gene in E. coli ATCC25923 during the LAMP reaction. Separation of two fragments of the enzyme can improve the activity of Klenow fragment of enzyme in LAMP.

خلاصه DNA پليمرازها علاوه بر كاربردشان در همسانه سازي و تصحيح ، در انواع تكنيك هاي ملكولي مانند تكثير DNA ، جهش هاي نقطه اي ، توالي يابي DNA ، انواع مختلف PCR ، LAMP و ...اهميت دارند. پس از كشف PCR تلاش هايي مبني بر تشخيص و جداسازي آنزيم هاي مقاوم به دماهاي بالا كه توانايي تكثير موثر DNA در دماهاي بالا انجام گرفت. در اين پژوهش ، سويه Geobacillus stearothermophilus strain 10 به منظور همسانه سازي ژن رمزگذار Bst DNA Polymerase استفاده گرديد. پس از استخراج DNA باكتري ، ژن مورد نظر با استفاده از پرايمر هاي طراحي شده و با روش PCR تكثيرگرديد. همسانه سازي ژن رمزگذار آنزيم در ناقل بياني pET32a و انتقال آن در باكتري E.coli BL21 صورت گرفت. پس از بيان ژن در ميزبان با استفاده از IPTG، پروتئين حاصل با استفاده از ستون هاي IMAC خالص سازي گرديد . براي تعيين كيفي فعاليت، آنزيم نوتركيب در واكنش LAMP به كار گرفته شد. نتايج نشان مي دهد آنزيم Bst Polymerase مي تواند جايگزين مناسبي براي نوع وارداتي آن باشد. كلمات كليدي: Bst DNA polymerase ، همسانه سازي، بيان ژن، LAMP, PCR