بررسي تنوع ژنتيكي ژن پروتئين پرايون در گوسفندان نژاد مهربان و رومانف

Evaluation of genetic variations of the PRNP gene in Mehraban and Romanov sheep breeds

اين پژوهش جهت بررسي چندشكلي در اگزون 3 ژن پروتئين پرايون (PRNP) در گوسفندان نژاد مهربان و رومانف انجام شد. از 124 رأس گوسفند (85 رأس نژاد مهربان و 39 رأس نژاد رومانف) نمونه‌هاي خون جمع‌آوري شد. پس از استخراج DNA، واكنش زنجيره‌اي پلي‌مراز با استفاده از يك جفت پرايمر اختصاصي جهت تكثير يك قطعه 173 جفت بازي از اگزون 3 ژن پروتئين پرايون بكار گرفته شد. چندشكلي‌هاي قطعه مورد نظر با استفاده از تكنيك SSCP و تعيين توالي DNA تعيين و مورد ارزيابي قرار گرفتند. در هر دو نژاد مهربان و رومانف، سه الگوي متفاوت باندي (ژنوتيپ‌هاي AA، AG و GG) همراه با يك چندشكلي تك‌نوكلئوتيدي (g.625A>G) شناسايي شد كه منجر به تغيير يك اسيد آمينه (p.171 R>Q) مي‌شود. سه هاپلوتايپ شامل ARR/ARR، ARR/ARQ و ARQ/ARQ شناسايي شد كه بيشترين فراواني (به ترتيب 61/2 و 46/15 درصد در نژاد مهربان و رومانف) مربوط به هاپلوتايپ داراي مقاومت بالا به بيماري اسكراپي (ARR/ARR) بود. نتايج پژوهش حاضر با توجه به شباهت چندشكلي‌ها در ژن PRNP نژادهاي داخلي و خارجي مي‌تواند در برنامه‌هاي اصلاح نژادي گوسفند مورد استفاده قرار گيرند.

This study was conducted to investigate the polymorphisms of the Prion protein gene (PRNP) exon 3 in Mehraban and Romanov sheep. Blood samples were collected from 124 sheep (85 Mahraban and 39 Romanov). After DNA extraction, polymerase chain reactions (PCR) were performed to amplify a 173 bp fragment of the PRNP gene exon 3 using a specific pair of primers. Polymorphisms of the studied fragments were explored using single strand conformational polymorphism (SSCP) and DNA sequencing analysis. In both Mehraban and Romanov breeds, three different banding patterns (AA, AG and GG genotypes) along with a single nucleotide polymorphism (g.625A>G) were identified, that deduced one amino acid substitution (p.171R>Q). Three haplotypes including ARR/ARR, ARR/ARQ and ARQ/ARQ were identified, which the most frequency (61.2 and 46.15% in Mehraban and Romanov breeds, respectively) was related to the ARR/ARR haplotype with high resistance to scrapie disease. The results of current study regarding the similarity of polymorphism in PRNP gene of domestic and foreign breeds could be used in sheep breeding programs.