مقايسه روش‌هاي متداول و روش مولكولي در تشخيص گونه‌هاي كانديداي جداشده از نمونه‌هاي اوروفارنژيال كانديديازيس

Comparison of Conventional and Molecular Methods in Identification of Candida Species Isolated from Oropharyngeal Candidiasis

اهداف: گونه‌هاي كانديدا فلور نرمال بدن انسان و عامل بيشترين عفونت‌هاي بيمارستاني در افراد داراي زمينه هستند. با توجه به اهميت تشخيص صحيح آنها، مطالعه حاضر با هدف مقايسه روش‌هاي رايج با روش مولكولي در تشخيص گونه‌هاي مختلف كانديدا به‌منظور يافتن روش بهينه انجام شد. مواد و روش‌ها: 60 ايزوله كانديداي جداشده از بيماران مبتلا به اوروفارنژيال كانديديازيس با استفاده از روش‌هاي رايج شامل توليد جرم تيوب، كشت روي محيط كروم آگار، استفاده از كيت API 20 C AUX و روش مولكولي ITS sequencing شناسايي شدند. ميزان توافق (ضريب k) بين روش‌هاي رايج در مقايسه با روش مولكولي با استفاده از نرم‌افزار SPSS 16.0 محاسبه شد. يافته‌ها: از 60 ايزوله كانديداي مورد مطالعه، 10 ايزوله (16/6%) در تست جرم تيوب، 8 ايزوله (13/33%) در تست API و 9 ايزوله (15%) در تست كشت روي محيط كروم آگار داراي تشخيص متفاوت در مقايسه با روش مولكولي ITS sequencing بودند. روش جرم تيوب بيشترين (0/90 =k) و كشت روي كروم آگار كمترين (0/66 =k) توافق را در مقايسه با روش مولكولي در شناسايي گونه كانديدا آلبيكنس نشان داد. نتيجه‌گيري: نتايج نشان داد كه روش‌هاي معمولي به‌تنهايي قادر به تشخيص همه گونه‌هاي كانديدا نيستند و روش‌هاي مولكولي مانند ITS sequencing، مي‌توانند براي تشخيص قطعي به كار برده شوند.

Aims Candida species are normal flora in the human body and are the main cause of hospital infections in people with underlying disease. The purpose of the present study was comparison of the conventional and molecular laboratory methods in identifying different species of Candida to find the optimal method. Materials & Methods 60 Candida isolates were obtained from oropharyngeal candidiasis patients and recognized using laboratory routine methods including germ tube production, culture on CHROMagar medium, API 20 C AUX kit and molecular ITS sequencing method. The concordances between the methods compared to the molecular method were measured by the kappa coefficient using SPSS 16.0 software. Findings Out of 60 Candida isolates, 10 isolates (16.6%) in germ tube formation test, 8 isolates (13.33%) in the API test, and 9 isolates (15%) in the culture on CHROMagar medium have different results in comparison to the ITS sequencing method. Germ tube (k= 0.90) and culture on CHROMagar medium methods (k= 0.66) showed the highest and the lowest agreement with the molecular method in the identification of Candida albicans species respectively. Conclusion The results showed that conventional methods alone cannot diagnose all Candida species and molecular methods such as ITS sequencing can be used to confirm the identification.