تيپ بندي مولكولي سويه هاي اشريشياكلي اوروپاتوژنيك(UPEC) در استان اصفهان و دسته‌بندي ژنتيكي جدايه‌هاي سروگروپ O25 به روش ERIC-PCR

Molecular Typing of Uropathogenic Escherichia coli Strains in Isfahan Province and Genetic Classification of Serogroup O25 Isolates by ERIC-PCR Method

سابقه و هدف: اشريشياكلي شامل طيف گسترده اي از سويه هاي مختلف در اكوسيستم ها با تنوع زياد در ژنوم آنها است. برخي از انواع سويه ها باعث ايجاد بيماري هاي جدي مانند عفونت هاي دستگاه ادراري (UTI) مي گردند. اشريشياكلي اوروپاتوژنيك (UPEC) شايع ترين عامل ايجاد عفونت ادراري در انسان است. هدف از اين مطالعه بررسي شيوع انواع سروگروپ هاي O در جدايه هاي اشريشياكلي جدا شده از بيماران مبتلا به عفونت ادراري در استان اصفهان و دسته‌بندي ژنتيكي جدايه‌هاي سروگروپ O25، به روش ERIC-PCR مي باشد. مواد و روش كار: 226 نمونه ادرار از بيماران مبتلا به عفونت ادراري در بيمارستان هاي استان اصفهان جمع آوري و مورد بررسي قرار گرفتند. جدايه هاي اشريشياكلي با استفاده از روش هاي بيوشيميايي شناسايي شدند. سروگروپ هاي اين جدايه ها به روش PCR تعيين و دسته بندي ژنتيكي جدايه هاي داراي سروگروپ O25 با استفاده از روش ERIC-PCR انجام گرفت. نتايج: از ميان كل نمونه هاي مورد مطالعه، 96 جدايه اشريشياكلي جدا گرديد. شايع ترين انواع سروگروپ O، O25(37/5 درصد)، O21(37/9 درصد) و O6(8/33درصد) بودند. دسته بندي ژنتيكي جدايه هاي داراي سروگروپ O25، 25 پروفايل مختلف را در ميان اين 36 جدايه نشان داد. نتيجه گيري: تكنيك ERIC-PCR روش سريع، حساس و ارزان قيمت مي باشد. وجود تنوع ژنتيكي در جدايه ها نشانگر منابع مختلف آلوده كننده دستگاه ادراري به اين باكتري است و اين روش يك تكنيك مناسب جهت تايپينگ مولكولي سويه هاي اشريشياكلي جدا شده از منابع مختلف عفونت هاي مجاري ادراري مي باشد.

Objective & Aim: Escherichia coli includes a wide range of different strains in ecosystems with huge diversity in their genomes. Some strains cause serious diseases, such as Urinary Tract Infections (UTI). Uropathogenic Escherichia coli (UPEC) is the most frequent agent causing UTI in humans. The aim of this study was to investigate the prevalence of O-serogroups among E. coli isolated from patients with UTI in Isfahan province and genetic classification of O25 serogroup isolates by ERIC-PCR method. Materials and Methods: 226 urine samples from patients with UTI were collected from hospitals in Isfahan province. E. coli isolates were identified using standard methods. Serogroups of these isolates were determined by PCR method and genetic classification of isolates with serogroup O25 was performed using ERIC-PCR method. Results: A total of 96 E. coli strains were isolated from the urine samples. The most common types of O antigens were O25(37.5%), O21(9.37%) and O6(8.33%). The genetic classification of isolates with serogroup O25 showed 25 different profiles among these 36 isolates Conclusion: ERIC-PCR technique is a quick, sharp and cost-effective method. It seemed that this technique to be a good approach for molecular typing of E. coli strains isolated from different urinary tract infections sources.