ايزوله‌هاي اسينتوباكتر‌بوماني جدا شده از گوشت خام دام و طيور به روش تايپينگ ترادف‌يابي چند‌جايگاهي (MLST)

Typing of the Acinetobacter baumannii strains isolated from row meat of poultry and livestock using Multi Locus Sequence Typing (MLST

سويه‌هاي اسينتوباكتر‌بوماني با مقاومت چند‌دارويي عمدتاً به عنوان پاتوژن‌هاي فرصت‌طلب در ايجاد عفونت‌هاي بيمارستاني و نيز به عنوان يك آلوده‌كننده در حال ظهور در مواد غذايي با منشاء دامي محسوب مي‌شوند. مطالعه حاضر با هدف تعيين الگوي مقاومت آنتي‌بيوتيكي و ژنوتايپينگ ايزوله‌هاي اين باكتري در گوشت خام دام و طيور انجام شد. 22 ايزوله جدا شده از انواع گوشت خام خوراكي با روش تايپينگ ترادف‌يابي چند‌‌جايگاهي و انتشار ساده ديسك آزمايش شدند. بيش‌ترين مقاومت آنتي‌بيوتيكي مربوط به تتراسيكلين با فراواني 90/90 درصد و كمترين ميزان مربوط به دو آنتي‌بيوتيك آزيترومايسين و ايمي‌پنم با 09/9 درصد بود. در 22 ايزوله اسينتوباكتر‌بوماني مورد بررسي 5 پروفايل (كلون=ST) ژنتيكي شامل ST15، ST10، ST12، ST25 وST25 شناسايي شد و 5 ايزوله به عنوان ايزوله‌هاي غير قابل تيپ‌بندي معرفي شدند. شناسايي ميزان قابل قبولي از تنوع ژنتيكي در بين ايزوله‌ها با استفاده از تكنيك MLST نشان مي‌دهد كه اين روش در مطالعه و تايپينگ ايزوله‌هاي اسينتوباكتر‌بوماني روش مفيدي به حساب مي‌آيد و مي‌توان ايزوله‌هاي با منشاء متفاوت را در گروه‌هاي مختلف تقسيم‌بندي نمود. در اين مطالعه مشخص گرديد كه با استفاده از توالي‌يابي ژن‌هاي خانه‌دار مي‌توان سويه‌هاي اسينتوباكتر‌بوماني را تايپ‌بندي نمود و اين مقدار پلي‌مورفيسم نشان مي‌دهد كه اين تكنيك روش مفيدي براي آناليز تنوع ژنتيكي سويه‌هاي اسينتوباكتر‌بوماني در نمونه‌هاي غذايي با منشاء دامي مي‌باشد.

Acinetobacter baumannii (A. baumannii) strains with multiple drug resistance are mainly opportunistic pathogens in the development of hospital infections and as an emerging contaminant in livestock-based foods. The aim of this study was to determine the antibiotic resistance pattern and genotyping of this bacterium strains in raw meat of poultry and livestock. 22 strains isolated from raw meat were tested by multi-locus sequence typing and simple disk diffusion methods. The highest antimicrobial resistance was observed to tetracycline with 90.9% and the least antibiotic resistance was azithromycin and imipenem with 9.09%. Five strains were identified as non-typing isolates in 22 isolates of A. baumannii. Five genetic profiles (Sequence Types=ST) including ST15, ST10, ST12, ST25, ST25 were identified. Identifying the acceptable level of genetic variation among isolates using the MLST technique indicates that this method is considered as a useful method in the study and typing of Acinetobacter spp. strains and can be strains isolated from different origins in different groups. In this study, it was found that by sequencing of house-keeping genes, it is possible to typing of Acinetobacter spp. strains, and this amount of polymorphism indicates that this technique is a useful method for analyzing the genetic diversity of A. baumannii strains is a source of animal origin.