مرکز منطقه ای اطلاع رساني علوم و فناوري - استفاده از روش هاي بيوانفورماتيك و سيتوژنتيك مولكولي در بررسي ناهنجاريهاي كروموزومي سلول هاي سرطان پوست القائي در رت هاي نژاد SD

چكيده فارسي :

يكي از مهم‌ترين اهداف تحقيقات در سرطان شناسي كشف تغييرات كروموزومي است كه در تشكيل سلو ل‌هاي نئوپلاستيك و تومورهاي بدخيم دخالت دارد. سرطان پوست در ايران بر طبق گزارش كشوري رتبه اول را در بين زنان ايران دارد. در اين تحقيق به مطالعه سرطان پوست القايي در موش‌هاي نژاد SD پرداخته مي‌شود و با روش‌هاي اينفورماتيك نواحي مشابه آنها در كروموزوم‌هاي انسان و همچنين مهم‌ترين ژن‌هاي كانديد در آن نواحي گزارش مي‌گردد. روش كار: در اين پژوهش از موش صحرائي نژاد SD به عنوان مدل حيواني جهت القاء سرطان پوست استفاده گرديد كه طي آنmg 10 از ماده كارسينوژنيك DMBAمحلول شده در روغن كنجد به رت‌هاي تحت تيمار به روش زير جلدي تزريق گرديد. از تومور‌هاي بدست آمده براي كشت سلولي و تهيه كروموزوم‌هاي متافازي استفاده شد. بعد از رنگ‌آميزي به روش GTG، كروموزوم‌هاي متافازي رنگ شده با ايدئوگرام موش صحرايي طبيعي مقايسه گرديد. با مطالعه كروموزوم‌هاي متافازي، مشترك‌ترين تغييرات كروموزومي بين مجموعه‌هاي كروموزومي ثبت گرديد. بر اساس چگونگي تغييرات و محل آن‌ها و با كمك پايگاه‌هاي اطلاعاتي، ليستي از ژن‌ها وهمچنين نقش احتمالي آن‌ها با توجه به روش مقايسه ژنوميك بين موش صحرايي و انسان تهيه شد. يافته‌ها: تغييرات كروموزومي ايجاد شده طيف وسيعي از ناهنجاري‌هاي عدي و ساختاري را شامل گرديد و بطور واضح، قطعاتي از كروموزوم‌هاي شماره 5، 8 و 9 دچار حذف شدگي و همجنين بخش‌هايي از كروموزوم شماره 7 دچار اضافه شدگي ساختاري گرديده بودند. همچنين با استفاده از روش سيتوژنتيك مولكولي فيش كاهش تعداد نسخه‌هاي ژني در ژن‌هاي CDKN2B و KLF4 در كروموزوم 5 رت‌هاي تيمار شده نشان داده شد. نتيجه‌گيري: با استفاده از روش‌هاي مقايسه ژنوميك و مطالعه مقالات علمي در ارتباط با ژن هاي مستقر در نواحي كروموزومي تغيير يافته، پيشنهاد مي‌گردد كه ژن‌هايCASP9،CDC2L1، CNR2، DFFA، DFFA، CCND3، EEF1A1، ASAP1، PTK2، DAG1، GPX1، MLH1، TGFBR2، TUSC2، KLF4، SLC31A1، CDKN2B، ELAVL2 و FANCG احتمالاً مي‌توانند از جمله مهم‌ترين ژن‌ها در بروز سرطان پوست در مدل ايجاد شده باشند، لذا اين گروه از ژن‌ها و ژن‌هاي مرتبط با آن‌ها براي مطالعات بيشتر و دقيق‌تر بطور كانديد پيشنهاد مي‌گردند.