بررسي حضور ژن‌هاي فرعي پيلي تيپ چهارم در سويه‌هاي سودوموناس آئروژينوزاي جدا شده از نمونه‌هاي باليني و غيرباليني

Investigating the Presence of Type IV Pilin Subgenus in Pseudomonas Aeruginosa Isolated from Clinical and Non-Clinical Samples

زمينه و هدف: پيلي تيپIV يك فاكتور كلونيزاسيون مهم براي پاتوژن فرصت طلب سودوموناس آئروژينوزا است، كه در شكل گيري بيوفيلم و اتصال به سلولهاي ميزبان نقش دارد. هر تيپ پيلي با يك ژن كمكي خاص كد مي شود. از اين رابطه ي مشخص ميتوان به عنوان يك هدف درماني براي تشخيص سويه هاي سودوموناس آئروژينوزا و همچنين تيپ بندي مولكولي آن استفاده كرد. هدف اين مطالعه ارزيابي فراواني تيپهاي مختلف ژنهاي كمكي در نمونه هاي فيبروز سيستيك(CF) ، سوختگي و محيطي مي باشد. مواد و روشها: نمونه هاي سودوموناس آئروژينوزا از بيمارانCF ، سوختگي و همچنين پسماندهاي محيطي در طي سال 95-94، جمع آوري گرديد. نمونه ها با استفاده از روشهاي استاندارد ميكروبي و بيوشيميايي كشت داده و شناسايي شد. استخراجDNA توسط جوشاندن انجام شد وPCR از طريق پرايمرهاي اختصاصي انجام شد. يافته ها: روي هم رفته 90 ايزوله ي سودوموناس آئروژينوزا( 35 نمونه محيطي، 30 نمونه سوختگي و 25 نمونه(CF مورد بررسي قرار گرفتTfpO . وTfpZ به ترتيب در 71 و 2 ايزوله مثبت بودند. نتيجه گيري: براساس نتايج بدست آمده ما نشان داديم كه تيپ پيلي سودوموناس آئروژينوزا بسيار متنوع است. صرف نظر از منبع نمونه ها، شايعترينTfp ،TfpO بود. با در نظر گرفتن اين واقعيت كهTfpZ فقط در نمونه هاي سوختگي ديده شد، ميتوان فرض كرد اين تيپ خاص ممكن است در شرايط حاد باليني ظاهر شود. در نهايت انجام اين مطالعه بر جامعه ي آماري بزرگتر و بهره گيري از روشهاي جامعتر تايپينگ را پيشنهاد ميكنيم.

Background and Aims: The type IV Pilin is an important colonization factor for opportunistic pathogens of Pseudomonas aeruginosa, which plays a role in the formation of biofilms and binding to the host cells. Each type of Pilin is coded with a particular auxiliary gene. This specific relationship can be used as a therapeutic target for detecting P. aeruginosa strains as well as its molecular classification. The purpose of this study was to evaluate the frequency of different types of auxiliary genes in cystic fibrosis, burns, and environmental samples. Materials and Methods: Pseudomonas aeruginosa samples were collected from patients with cystic fibrosis, burns as well as environmental wastewaters during 2016-2017. Samples were cultured and identified using standard microbial and biochemical methods. DNA extraction was performed by boiling and PCR was performed through specific primers. Results: Totally, 90 isolates of P. aeruginosa samples (35 environmental, 30 burns, and 25 cystic fibrosis) were examined. tfpO and tfpZ were positive in 71 and 2 isolates, respectively. Conclusion: The results indicated that Pseudomonas aeruginosa Pilin types are very diverse. Regardless of the source of the samples, the most common tfp was tfpO. Taking into account the fact that tfpZ was found only in burns, it can be assumed that this particular type may appear in severe clinical conditions. Ultimately, larger statistical population and use of more comprehensive typing methods is suggested for better results.