تشخيص مولكولي سرووار بيماري‌زاي سالمونلا انتريتيديس به روش LAMP با استفاده از ماركر اختصاصي غربال‌شده به‌وسيله روش‌هاي ژنوميك مقايسه‌اي

زمينه و اهداف: سالمونلا انتريتيديس يكي از شايع ترين علل گاستروانتريت مي باشد كه در موارد حاد مي تواند منجر به سپتي سمي و يا حتي مرگ شود. در مطالعه حاضر با استفاده از روش هاي ژنوميك مقايسه اي ماركرهاي ژني اين سرووار غربال گرديد و اختصاصي ترين ماركر با استفاده از روش LAMP براي شناسايي اين پاتوژن مورد هدف قرار گرفت. مواد و روش كار: اين مطالعه در سال 1394 صورت گرفت. بمنظور يافتن ماركرهاي ژني سالمونلا انتريتيديس ، 50 ژنوم كامل از سويه هاي سالمونلا انتريتيديس و ساير جنس هاي خانواده انتروباكترياسه با استفاده از روش هاي ژنوميك مقايسه اي موردبررسي قرار گرفتند. ماركر اختصاصي غربال شده با طراحي 6 پرايمر اختصاصي و با استفاده از روش LAMP به منظور شناسايي سويه هاي سالمونلا انتريتيديس هدف قرار گرفت (سويه هاي باكتريايي مورد استفاده در اين مطالعه از بيمارستان هاي جنوب شرق كشور جمع آوري گرديد). كارايي روش LAMP براي شناسايي سالمونلا انتريتيديس در نمونه هاي گوشت مرغ كه بصورت مصنوعي به اين باكتري آلوده شده بودند، نيز مورد ارزيابي قرار گرفت. يافته ها: ژن lygC به عنوان اختصاصي ترين ماركر براي شناسايي سويه هاي سالمونلا انتريتيديس انتخاب شد. نتايج حاصل از روش LAMP اختصاصيت اين ماركر را براي شناسايي ايزوله هاي سالمونلا انتريتيديس نشان داد. حساسيت اين روش براي كشت خالص باكتري CFU/reaction 10 و براي نمونه هاي گوشت مرغ آلوده CFU/mL 103 در آغاز انكوباسيون و CFU/mL 10 بعد از 4 ساعت انكوباسيون ارزيابي گرديد. نتيجه گيري: پژوهش حاضر اثبات مي كند كه روش ژنوميك مقايسه اي روشي كارآمد براي شناسايي ماركرهاي ژني اختصاصي مي باشد. همچنين روش LAMP حاضر مي تواند يك ابزار قدرتمند، دقيق و ارزان جهت شناسايي سالمونلا انتريتيديس در آزمايشگاه هاي كنترل كيفي مواد غذايي و تشخيص طبي باشد.