ژنوتايپينگ بيست و پنج SNP اتوزومال با درجه آگاهي بخش بالا در جمعيت استان خوزستان با استفاده از روش SNapShot

فاقد عنوان لاتين

استفاده از پلي مورفيسم هاي تك نوكلئوتيدي (SNPs) در تشخيص هويت ژنتيكي كاربردهاي گسترده اي را نشان داده است. در جمعيت ايراني جهت ارزيابي فركانس آللي و نيز تعيين تنوع ژنتيكي SNP ها بر مبناي پايگاه SNIPforID مطالعات محدودي گزارش شده است. مطالعه حاضر با هدف بررسي تنوعات ژنتيكي، تعيين فراواني آللي و ارزيابي هتروزيگوسيتي، به طور همزمان در بيست و پنج جايگاه SNP اتوزومال آگهي بخش در استان خوزستان با تكنيك SNapShot اجرا شد.در مطالعه حاضر، نتايج ارزيابي هاي بيوانفورماتيكي نشان داد حداقل 25 جايگاه SNP اتوزمال قدرت تمايز بين قوميت هاي ايراني را داشتند. استخراج DNA از نمونه­ ي خون 50 نفر از افراد با قوميت عرب با روش فنول-كلروفورم انجام شد. تعيين ژنوتيپ SNP هاي منتخب با استفاده از روش SNapShot با دستگاه ژنتيك آنالايزر اجرا شد. آناليز هاي آماري همچون فركانس اللي و تعادل هاردي واينبرگ با استفاده از نرم افزار هاي Arlequine 3.5 و GenALEX 6.5 محاسبه شد. ميانگين هتروزيگوسيتي مشاهده شده برابر با 0/442 بود. كمترين هتروزيگوسيتي محاسبه شده مربوط به rs2056277 به ميزان 0/080 به دست آمد. كمترين فركانس اللي براي rs2056277 برابر با 0/040 محاسبه شد. مجموع فركانس آللي SNP هاي مورد مطالعه از تعادل هاردي-واينبرگ به استثناء rs938283, rs1413212 و rs354439 انحراف نشان دادند. ارزيابي همزمان 25 جايگاه اتوزمال SNP توانايي ايجاد تمايز بين قوميت هاي درون جمعيتي را دارد. نتايج نشان داد قوميت عرب از نظر ژنتيكي با قوميت هاي لر، فارس و كرد مشابه مي باشد. روش SNapShot از حساسيت و اختصاصيت مناسبي جهت ژنوتايپينگ SNP هابه طور همزمان برخودار بود.

فاقد چكيده لاتين