بررسي تنوع پروكاريوت‌هاي اكوسيستم شور به روش غيرقابل كشت

اهداف: ميكروارگانيزم‌ها علاوه بر محيط‌هاي معمولي در محيط‌هاي افراطي هم حضور دارند. درياچه‌هاي نمك با شوري در حد اشباع در سراسر جهان پراكنده‌ هستند. يكي از اين محيط‌هاي پرشور درياچه اروميه است. هدف مطالعه حاضر بررسي تنوع پروكاريوت‌هاي اكوسيستم شور درياچه اروميه به روش غيرقابل كشت بود. مواد و روش‌ها: در پژوهش تجربي حاضر از مناطق مختلف درياچه اروميه نمونه‌برداري شد و ماده ژنومي استخراج‌شده از نمونه آب شاخص به‌عنوان الگو براي تكثير قطعه ۱۶S rDNA و قطعه‌اي از ژن bop از طريق واكنش زنجيره‌اي پليمراز مورد استفاده قرار گرفت. با روش كلونينگ هر يك از قطعات تكثيرشده كه مربوط به يك سويه منفرد بودند توسط كيت T/A وكتور تكثير يافتند. براي بررسي بيشتر تنوع زيستي هالوآركي‌ها به‌موزات بررسي ۱۶S rDNA، تنوع زيستي ژن bop نيز مطالعه شد. يافته‌ها: با روش كلونينگ و توالي‌يابي شش جنس باكتري شامل آكاريوكلوريس، ادهيري‌باكتر، براكي‌باكتريوم، گلوئوكپسوپسيز، سيزري‌باكتر و باسيلوس شناسايي شدند. كتابخانه ژني آركي‌ها متعلق به پنج جنس شامل هالونوتيوس، هالولامينا، هالوكوادراتوم، هالوميكروآركولا و هالورهابدوس بودند. كتابخانه كلون‌هاي باكتريايي نيز در چهار راسته باكتريوئيدز، سيانوباكتر، اكتينوباكتر و فرميتيكوس قرار داشتند. ‌كلون‌هاي كتابخانه قطعه‌اي از ژن bop (به عنوان يك ماركر مولكولي) متعلق به چهار جنس شامل هالوروبروم، نتري‌آلبا، هالوكوادراتوم و نترينما بودند. فيلوژني bop با فيلوژني ۱۶S rDNA رابطه تنگاتنگي نشان داد. نتيجه‌گيري: با روش كلونينگ و توالي‌يابي شش جنس باكتري شامل آكاريوكلوريس، ادهيري‌باكتر، براكي‌باكتريوم، گلوئوكپسوپسيز، سيزري‌باكتر و باسيلوس شناسايي شدند. فيلوژني bop با فيلوژني ۱۶S rDNA رابطه تنگاتنگي دارد.