توالي‌يابي de novo ترانسكريپتوم و آناليز عملكردي ژن‌هاي با بيان متفاوت بذرهاي بزرگ و كوچك گياه توق خاردار (Xanthium strumarium L.) در دوره نمو

گياه توق خاردار (Xanthium strumarium L.) گياهي هرز با ارزش دارويي بالا است كه به دليل وجود خواب عميق فقط در يكي از دو بذر درون يك كپسول اين گياه، براي مطالعات خواب بذر بسيار مورد علاقه پژوهشگران است. با اين وجود، نبود اطلاعات ژنوميك در اين گياه، سبب شده است كه دانسته‌ها در مورد آن در سطح بسيار پاييني باشد. در اين تحقيق، ترانسكريپتوم بذرهاي كوچك و بزرگ اين گياه در طول دوره نمو با استفاده از پلتفرم Illumina، با هدف شناسايي و بررسي عملكردي رونوشت‌هاي با بيان متفاوت ميان دو بذر، توالي‌يابي شد. توالي‌هاي شناسايي شده بين دو بذر با يكديگر مقايسه شدند و رونوشت‌هاي با بيان متفاوت بين دو بذر مورد تفسير عملكردي قرار گرفتند. در اين پژوهش تعداد 191192 توالي ژن با ميانگين طول 989.69 جفت‌باز شناسايي شد. آناليزهاي تشابه توالي و تفسير عملكردي اين توالي‌ها برعليه پايگاه داده nr، آناليز GO و KEGG انجام شد. ‌ژن‌هاي با بيان متفاوت، از نظر top hits، بيشترين تشابه را با آفتابگردان زراعي (83.41 درصد) داشتند. آناليز GO سبب شناسايي 615 تفسير عملكردي در 36 گروه شد. فراوان‌ترين GO يافت شده در دسته فرايند بيولوژيك، فرايندهاي بيوسنتزي بود. نتايج اين تحقيق فرايندهاي بيوسنتزي و متابوليك بيشتر را در بذر بزرگ نسبت به بذر كوچك‌تر و نقش تنظيمي كليدي رونويسي را در دوره نمو بذر نشان داد.