تعيين اپي توپ هاي ناپيوسته زنجيره سبك ايمونوگلوبولين انسان توسط ايمونولوژي محاسبه اي

زمينه و هدف: ايمونوگلوبولين ها(Igs) گروهي از پروتئين هاي سرم هستند كه نقش مهمي در دفاع عليه ميكروارگانيسم ها بر عهده دارند. ايمونوگلوبولين ها از زنجيره هاي سبك و سنگين تشكيل شده اند. زنجيره هاي سبك بر اساس تفاوت در انتهاي كربوكسيلي ناحيه ثابت خود به دو ايزوتيپ كاپا (κ) و لامبدا (λ) تقسيم مي شوند. تغييرات قابل توجهي در نسبت زنجيره هاي كاپا به لامبدا مي تواند در گسترش منوكلونال لنفوسيت هاي B در بدخيمي سلول هاي B يا در عفونت با ويروس ايدز در دوران جنيني روي دهد. به منظور سنجش دقيق يا هدف گيري اختصاصي زنجيره هاي سبك براي اهداف درماني، ابزارهايي شناسايي اختصاصي داراي حساسيت و ويژگي بالا از جمله آنتي بادي هاي منوكلونال مورد نياز هستند. در اين راستا تعيين دقيق اپي توپ هاي اختصاصي زنجيره هاي سبك حائز اهميت خاصي است. ايمونولوژي محاسبه اي شاخه اي از علم ايمونولوژي است كه با به كارگيري اطلاعات زيستي موجود در كامپيوتر به تشخيص دقيق تر بيماري ها كمك مي كند. هدف مطالعه حاضر بررسي و تعيين اپي توپ هاي ناپيوسته زنجيره سبك ايمونوگلوبولين انسان توسط ايمونولوژي محاسبه اي مي باشد. روش كار: توالي اسيدهاي امينه و ساختار سوم زنجيره سبك ايمونوگلوبولين G مرجع انسان در پايگاه اطلاعاتي PDB (Protein Data Bank)، ساختار دوم زنجيره سبك ايمونوگلوبولين توسط نرم افزار Phyre2 (Protein Homology/analogy Recognition Engine V 2.0) و اپي توپ هاي ناپيوسته زنجيره سبك ايمونوگلوبولين G مرجع انسان توسط نرم افزار CEP تعيين شدند. يافته ها: در اين مطالعه 5 اپي توپ ناپيوسته در دومين ثابت زنجيره سبك ايمونوگلوبولين G انسان توسط نرم افزار CEP شناسايي شد. اپي توپ هاي فوق الذكر درناحيه قرارگيري اسيدهاي آمينه شماره 100 الي 214 واقع شده اند. نتيجه گيري: در اين پژوهش تعدادي از اپي توپ هاي ناپيوسته دومين ثابت زنجيره سبك ايمونوگلوبولين G انسان شناسايي شدند. اين اپي توپ ها ابزارهاي بسيار ارزشمندي جهت توليد آنتي بادي هاي مونوكلونال اختصاصي زنجيره سبك ايمونوگلوبولين انسان بوده و مي توانند به طور بالقوه براي توليد كيت هاي تشخيص اختصاصي زنجيره سبك، درمان برخي از بدخيمي هاي لنفوسيت B، تعيين نقشه اپي توپ هاي زنجيره سبك ايمونوگلوبولين انسان و مطالعات تكاملي مفيد باشند.