آناليز آماري بيان آنتي‌ژن MAGE-A4 در سرطان‌هاي وابسته و پيش بيني عرضه آنتي‌ژن با مولكول HLA-B37 مبتني بر روش‌هاي بيوانفورماتيكي

زمينه و هدف: ايمونوتوكسين ها از جمله راهبردهاي اميدوار كننده در درمان هدفمند سلول هاي سرطاني هستند كه با مكانيسم اتصال اختصاصي به آنتي ژن هاي توموري عمل مي كنند. لذا واكاوي اين نوع از آنتي ژن ها و پايش ويژگي هاي ساختاري و عمكردي آن ها فراهم كننده بستري در ارتباط با توسعه اين نوع از داروها مي باشد. در اين تحقيق، مطالعه خانواده آنتي ژني MAGE بر اساس آزمون هاي بيوانفورماتيكي در دستور كار قرار گرفته است. روش كار: در گام نخست، آناليزآماري بيان آنتي ژن هاي خانواده MAGE در انواع سرطان ها با استفاده از برنامه SPSSانجام گرفت. بعد از تعيين MAGEA4 به عنوان آنتي ژن برتر، براساس مرور منابع، اپي توپ هاي اتصالي MAGEA4 با ايزوفرم هاي مختلف HLAشناسايي شد. سپس با استفاده از برنامه هاي BIMAS و SYFPEITHI اپي توپ هاي اتصالي گزارش شده در منابع تائيد شد. شاخص پايداري و ايمونوژنسيتي اپي توپ ها به ترتيب با استفاده از برنامه هاي PROTPRAM وIEDB انجام شد. به منظورتعيين ميل اتصالي و پايداري كمپلكس HLA-B37-peptide درشرايط شبه واقعي، نرم افزارهاي اتوداك وينا وگرومكس 5.1 مورداستفاده قرارگرفت. يافته ها: نتايج حاصل از اين آزمون منجر به آشكارسازي ميزان و گستره بياني بالاي MAGEA4 در مقايسه باساير اعضاي اين خانواده شد. همچنين پپتيد VDELAHFLLمشتق شده ازMAGEA4 با بالاترين ميزان پايداري وايمونوژنسيتي مطلوب آشكارشد. از سوي ديگر كمپلكس HLAB37VDELAHFLL با پايين ترين ميزان نمودار RMSD به عنوان پايدارترين كمپلكس ارزيابي گرديد. نتيجه گيري: به طوركلي نتايج حاصل از اين تحقيق نشان دادكه پپتيد مورد نظر VDELAHFLL از آنتي ژن MAGEA4 ممكن است در توليد آنتي بادي مونوكلونال وتوسعه واكسن در درمان مدرن سرطان مدنظر قرارگيرد.