تعيين توالي وآناليز فيلوژني ژن NS دو جدايه‌ي آنفلوانزاي 2N9H و بررسي خصوصيات رشد اين ويروس‌ها بر روي سلول‌هاي 549A

مقدمه: ويروس‌ آنفلوانزاي پرندگان تحت تيپ 2N9H در طول دو دهه‌ي گذشته در آسيا به صورت پانزوتيك در آمده است. اين ويروس، علاوه بر ايجاد بيماري در طيور پرورشي، چندين مورد ابتلاي انساني در آسيا را سبب شده است. اين مطالعه به منظور بررسي‌ ارتباط فيلوژني ژن غير ساختماني (NS يا Non structural) و خصوصيات رشدشان بر روي سلول‌هاي 549A در جدايه‌هايي در استان تهران انجام شد. روش‌ها: از ميان ويروس‌هاي ايزوله شده در سال‌هاي 91-1388 ويروس آنفلوانزاي 2N9H، دو ويروس كه در درخت فيلوژنتيك جايگاه‌هاي متفاوتي با هم داشتند، انتخاب شدند و ژن NS طي واكنش RT-PCR (Reverse transcription-polymerase chain reaction) تكثير شد. قطعه‌ي مورد نظر هر جدايه، كلون گرديد و پلاسميدهاي حاصل توالي‌يابي شدند. بروز تغييرات احتمالي در توالي‌ ژن NS جدايه‌هاي مورد نظر با مقايسه با جدايه‌هاي ثبت شده در پايگاه داده GenBank ارزيابي شد. بر اساس نتايج، رشد اين دو جدايه در سلول‌هاي 549A بررسي شد. ارزش s3GC و مقايسه‌ي ميزان جايگزيني Ka/Ks در نواحي رمز دهنده‌ي ژن بررسي شد. يافته‌ها: پردازش اوليه‌ي داده‌هاي فيلوژني نشان داد كه ژن NS ويروس‌‌هاي ايران با همساني 96/4 درصد به زير دودمان 439Y و آلل A تعلق دارند. اين ويروس‌ها بر اساس زمان جداسازي در دو زير گروه زير گروه يك شامل ويروس‌هاي جدا شده از طيور پرورشي طي سال‌هاي 2004-1998 و زير گروه دوم ويروس‌هاي جدا شده طي سال‌هاي 11-2006 قرار گرفتند. ارزش s3GC بين 0/392-0/371 متغير بود و ميزان Ka/Ks براي زير گروه اول 0/38 و براي زير گروه دوم 0/42 محاسبه شد. نتيجه‌گيري: پردازش توالي اسيد آمينه‌ي NS نشان مي‌دهد كه اين دو ايزوله، داراي توالي KSLR در محل دمين PDZ خود هستند و چندين تغيير همزمان در طول توالي اسيد آمينه رخ داده ‌است. عيار دو ويروس به روش ارزيابي پلاك برآورد شد كه تفاوت معني‌داري با هم نداشتند. اين داده‌ها نشان مي‌دهد كه دو ويروس 2N9H جديد ايران دچار تغييرات بسيار اندكي شده‌اند.