بررسي وجود ژن cry در باسيلوس ترينجينسيس ‌هاي جدا شده از خاك

زمينه و هدف: باسيلوس ترينجينسيس باكتري گرم مثبت و اسپورزا است. اصلي ترين زيستگاه اين باكتري خاك بوده و توانايي توليد انواع متنوعي از پروتئين هاي كريستالي با خاصيت حشره كشي را داراست. هدف از اين مطالعه جداسازي سويه هاي باسيلوس ترينجينسيس حمل كننده ژن Cryاز خاك هاي نقاط مختلف استان تهران با استفاده از روش MultiplexPCR بود. روش بررسي: در اين مطالعه توصيفي ـ تحليلي مقدار 200 گرم خاك از عمق 10 سانتي متري به طور تصادفي و در مجموع تعداد 100 نمونه خاك از مناطق مختلف شهر تهران جمع آوري شد. سپس بر اساس پروتوكل تأييد شده به وسيلهWHO، كلني هاي مشكوك به باسيلوس تورنجينسيس جداسازي و ايزوله ها از نظر تست هاي ميكروبيولوژيكي و بيوشيميايي تأييد شدند. پس از استخراج DNA از تمامي سويه ها، با استفاده از 16S rDNA PCR Sequencing باسيلوس ترينجينسيس بودن سويه هاي حاوي ژن Cry تأييد شد، داده ها با استفاده از آزمون آماري واريانس يك طرفه تجزيه و تحليل شدند. يافته ها: در نمونه هاي خاك مورد بررسي، 41 سويه باسيلوس تورينجنسيس شناسايي شد. نتايج MPCR نشان داد كه از 14 سويه حامل توكسين كريستالي، 7 سويه (50 درصد) به تنهايي واجد ژن cry1، 4 سويه (5/28درصد) به تنهايي واجد ژن cry2 و 3 سويه (5/21 درصد) به تنهايي واجد ژن cry3 بودند و باندهاي مربوطه را نشان دادند. ژنcry4 و cry5 در هيچ كدام از ايزوله ها (صفردرصد) مشاهده كن. نتيجه گيري: با توجه به تنوع بسيار زياد ژن پروتئين كريستالي و عدم وجود روش هاي فنوتيپي دقيق در شناسايي حضور پروتئين كريستالي، بنابراين تشخيص هم زمان اين ژن ها مي تواند با هزينه اندك و سرعت العمل زياد باسيلوس هاي حاوي ژن كريستالي را شناسايي نمايد.