شناسائي ژن عامل رونويسي متصل شونده به عناصر پاسخ دهنده به كم‌آبي (DREB2) در علف هرز بروموس‌ ژاپني (Bromus japonicus) تحت شرايط تنش شوري

Identification of dehydration-responsive element binding transcription factor gene in Bromus japonicus under salinity stress

گونه‌هاي گياهي مهاجم كه به عنوان علف هرز شناخته مي شوند گياهان مقاوم به شرايط نامساعد محيطي هستند كه از اين ويژگي مي‌توان در جهت دستكاري‌هاي ژنتيكي و تراريختي جهت مقاوم كردن گياهان زراعي استفاده نمود. اين تحقيق با هدف شناسائي ژن درگير در تحمل گياهان به تنش‌هاي غيرزنده و محيطي با نام DREB2 در علف هرز بروموس ژاپني اجرا گرديد. بدين منظور ابتدا تنش شوري به گياه بروموس ژاپني با بكارگيري نمك كلريد سديم اعمال گرديد و پس از آن با توالي‌يابي و شناسائي ژن موثر در عمل مقاومت به تنش در اين گياه، توالي بدست آمده مورد بررسي قرار گرفت. تحليل و مقايسه توالي بدست آمده با توالي اين ژن در گياهان ديگر با نرم افزارهاي مختلف ار قبيل BLAST، ExPasy، ELM، ClustalW و MegAlign صورت گرفت. نتايج مويد اين مطلب بود كه قطعه تكثير شده، مربوط به بخشي از ژن سنتز كننده فاكتور رونويسي متصل شونده به عناصر پاسخ دهنده تحت تنش شوري در اين گياه مي‌باشد. مقايسه توالي ژن DREB2 گياه بروموس ژاپني با ساير توالي‌هاي اين ژن در گونه‌هاي گياهي ديگر، ثابت كرد كه Bromus japonicus و Aegilops tauschii با 9/89 درصد بيشترين شباهت (كمترين فاصله ژنتيكي) را دارد. تجزيه و تحليل بيوانفورماتيكي توالي اسيدآمينه حاصل از ترجمه توالي نوكلئوتيدي ژن DREB2 در اين گياه از طريق نرم‌افزار CDDsearch نشان داد كه در اين توالي، ناحيه DomainAP2 وجود دارد. اين توالي با شماره دسترسي KP406596 در بانك جهاني ژن (NCI) به ثبت رسيد.

Invasive plant species that are characterized as weed, plants are resistant to environmental hard conditions that this feature can be used to the genetic alternation and transformation to resistant crops. The aim of this study was identification of gene involved in tolerance to abiotic environmental stresses in the Bromus japonicus called DREB2. in this subject, salinity stress was applied via sodium chloride, Sequencing and Identification of stress resistance gene in this plant and then sequence obtained was examined. Sequence Analysis and Comparing sequence obtained with sequences this gene in other plants was performed with softwares such as BLAST, ExPasy, ELM, Clustal W, Meg Align. The result was showed that the amplified fragment belonged to part of salinity-responsive element binding-factor gene in this plant. The comparison DREB2 gene sequence with other sequences this gen in the other plant species was confirm the Bromus japonicus and Aegilops tauschii have the most similarity with 89.9% the highest likeness (the lowest genetic distance). Bioinformatics analysis of the amino acid sequence of the translated nucleotide sequence of the gene DREB2 in the Bromus japonicus through software CDD search showed that AP2 Domain area is in this sequence, These sequence was submitted to GenBank, Its accession code is KP406596.