پديد آورندگان :
بهرامي، ابوالفضل دانشگاه تهران - پرديس كشاورزي و منابع طبيعي، كرج , ميرائي آشتياني، رضا دانشگاه تهران - پرديس كشاورزي و منابع طبيعي، كرج , صادقي، مصطفي دانشگاه تهران - پرديس كشاورزي و منابع طبيعي، كرج , نجفي، علي دانشگاه علوم پزشكي بقيه الله الاعظم، تهران
كليدواژه :
تخمدان , ترانسكريپتوم , داده‌كاوي , شبكه , ماژول عملكردي
چكيده فارسي :
آخرين مرحلۀ فوليكولوژنسيز در فوليكول تخمدان پستانداران شامل بيشترين توسعه و اوج فعاليت لايه هاي بافت پوششي (اپيتليال) ياخته هاي گرانولوزا است كه حفرۀ آنترال را احاطه كرده اند. در طول رشد و توسعۀ فوليكول، ياخته هاي گرانولوزا تكثير مي شوند و هورمون هاي لازم براي رشد اووسيت را ترشح ميكنند. در گاو، فوليكول نياز به رشد تا قطر بالاي 10 ميلي‌متر دارد تا آماده براي تخمك ريزي شود و پس از اين مرحله ياخته هاي گرانولوزا تغيير كرده و تبديل به تودۀ ياخته هاي ويژهاي بنام جسم زرد مي شوند. براي درك بهتر اساس مولكولي رشد فوليكولي و بلوغ ياخته هاي گرانولوزا، پروفايل ترانسكريپتوم ياخته هاي گرانولوزا از كوچك (<5mm) تا بزرگ (>10mm) با استفاده از روش داده كاوي بررسي شد. درمجموع با مقايسۀ ترانسكريپتوم ياخته هاي گرانولوزاي بزرگ و كوچك درمجموع 283 ژن شناسايي شدند. با بازسازي شبكه و تجزيۀ آن موفق به شناسايي آثار متقابل آنها و درنهايت با استفاده از ابزارهاي مختلف در زمينۀ پيدا كردن ماژول هاي مهم و عملكردي، شش ماژول شناسايي شد كه مهم‌ترين ژنهاي مرتبط شامل αTNF، NR1H4، LHCGR، FSHR، PTHLH، LHB، CAD، HSD3B1، CYP17A1، DICE1، MCE1، COX و آروماتاز بودند. اين مشاهده‌ها توصيه ميكند كه شش ماژول شناسايي‌شده در بررسي مي‌توانند به‌عنوان نشانگرهايي براي مرحلۀ نهايي تمايز فوليكول و آغاز مرگ ياخته باشند.
چكيده لاتين :
At the later stage of folliculogenesis, the mammalian ovarian follicle contains layers of epithelial granulosa cells surrounding an antral cavity. During follicle development, granulosa cells replicate, secrete hormones and support the growth of the oocyte. In cattle, the follicle needs to grow over 10 mm in diameter to allow an oocyte release in ovulation process, following which the granulosa cells cease dividing and differentiate into the specialized cells of the corpus luteum. To better understand the molecular basis of follicular growth and granulosa cell maturation, we undertook the transcriptome profiling of granulosa cells from small (< 5 mm; n = 10) and large (> 10 mm, n = 4) healthy bovine follicles, using data mining. In this regard, we have studied important genes that are included in folliculogenesis process using data, freely available in the different databases. In total 283 genes were identified with the comparison of transcriptome profiling of large and small granulosa cells. With construction and analysis of network, we became able to identify the interaction between them and finally we have found 6 important and functional modules using various software. The most important genes involved, were TNFα, NR1H4, LHCGR, FSHR, PTHLH, LHB, CAD, HSD3B1, CYP17A1, DICE1, MCE1, COX and Aromatase. These results suggest that identified modules can be used as markers for follicle differentiation and apoptosis process.
