عنوان مقاله :
مسيرهاي مربوط به microRNA-1 و مقايسه بيان آن در سرم اهداكنندگان خون با نتيجه مثبت آزمايش HIV نسبت به افراد سالم
پديد آورندگان :
قادري ، ميلاد دانشگاه علوم پزشكي بوشهر - دانشكده پيراپزشكي - گروه هماتولوژي , خميسي‌پور ، غلامرضا دانشگاه علوم پزشكي بوشهر - دانشكده پيراپزشكي - گروه هماتولوژي , عبيدي ، نرگس دانشگاه علوم پزشكي بوشهر - دانشكده پيراپزشكي - گروه هماتولوژي , طهماسبي ، رحيم دانشگاه علوم پزشكي بوشهر - دانشكده بهداشت - گروه آمار زيستي , محمدي ، امين دانشگاه علوم پزشكي بوشهر - دانشكده پيراپزشكي - گروه هماتولوژي , راستگو ، راضيه دانشگاه علوم پزشكي بوشهر - دانشكده پيراپزشكي - گروه هماتولوژي , بهبهاني‌پور ، مولود دانشگاه اصفهان - دانشكده علوم پايه - گروه زيست‌شناسي سلولي و مولكولي
كليدواژه :
عفونت , HIV , miR , سرم , ماركر مولكولي
چكيده فارسي :
زمينه: ريز RNAها (miRNA)، مولكول‌هاي RNA غيركننده (24-19 نوكلئوتيدي) هستند كه در طيف وسيعي از فرايندهاي زيستي از طريق تنظيم پس از رونويسي بيان ژن، نقش مهمي ايفا مي‌كنند. تغيير بيان miRNAها در بيماري‌هاي عفوني مختلف نظير عفونت HIV گزارش شده است. تعيين پروفايل‌هاي بياني miRNA خصوصاً در مايعات زيستي پستانداران كه متأثر از فرايندهاي داخل سلولي نقاط مختلف بدن مي‌باشد ديد جامعي در ارتباط با تغييرات پاتوفيزيولوژي مرتبط با برهمكنش‌هاي ويروس ميزبان در اختيار مي‌گذارد. از اين رو هدف از مطالعه حاضر بر پايه تجزيه و تحليل بيوانفورماتيكي miR-1 در ارتباط با مسيرهاي پيام‌رسان متأثر بالقوه در عفونت HIV، تعيين پروفايل بياني miR-1 در سرم اهداكنندگان خون با نتيجه آزمايش HIV مثبت نسبت به افراد سالم در مركز انتقال خون بوشهر مي‌باشد.مواد و روش‌ها: تجزيه و تحليل غني‌سازي روي ژن‌هاي هدف پيش‌بيني شده براي miR-1 بر پايه ابزارهاي بيوانفورماتيكي مرتبط به miRNAها براي دستيابي به مسيرهاي احتمالي تحت تنظيم اين miRNA صورت گرفت، با توجه به مسيرهاي متأثر در عفونت HIV و درگيري ژن‌هاي هدف miR-1 در اين مسيرهاي سيگنالينگ، ارزيابي بيان miR-1 در نمونه‌هاي سرم خون 20 فرد HIV مثبت تحت درمان، 10 فرد HIV مثبت تازه تشخيص داده شده و 40 فرد سالم بوسيله qRT-PCR انجام پذيرفت. داده‌ها با نرم‌افزار آماري SPSS ويرايش 22 مورد تجزيه و تحليل قرار گرفتند. يافته‌ها: تجزيه و تحليل غني‌سازي شده براي ژن‌هاي هدف miR-1 نشان مي‌دهد كه ژن‌هاي هدف به ميزان قابل توجه (0.05 FDR) در 4 مسير پيام‌رسان هورمون تيروئيد، مسيرهاي سرطان، اندوسيتوز، سيستم پيام‌رسان فسفاتيديل اينوزيتول متمركز شدند، علاوه بر اين، افزايش بيان قابل توجه miR-1 (P 0.05) در افراد مبتلا به HIV تازه تشخيص داده شده نسبت به افراد سالم، همچنين كاهش بيان قابل توجه miR1 (P 0.001) در افراد HIV مثبت تحت درمان نسبت به افراد مبتلا به HIV تازه تشخيص داده شده مشاهده گرديد. نتيجه‌گيري: مطالعات بيوانفورماتيك حاكي از آن است كه ژن‌هاي هدف پيش‌بيني شده براي miR-1 متعلق به مسيرهاي مرتبط با هورمون تيروئيد، سرطان، اندوسيتوز و سيستم پيام‌رسان فسفاتيديل اينوزيتول مي‌باشند؛ كه از جمله مسيرهاي مختل شده در عفونت HIV مي‌باشند. علاوه بر اين، تغيير بيان قابل توجه miR-1 در سرم خوني بيماران مبتلا به HIV تازه تشخيص داده شده نسبت به افراد سالم و افراد HIV مثبت تحت درمان نسبت به بيماران مبتلا به HIV تازه تشخيص داده شده تأثيرات قابل توجه فرايندهاي بيماري‌زايي ويروس HIV بر بيان miR-1 را نشان مي‌دهد. از اين رو، يافته‌هاي اين مطالعه نشان دهنده پتانسيل استفاده از miR-1 در راستاي درك بهتر بيماري‌زايي ويروس HIV و مداخلات درماني متعاقب بواسطه هدف قرار دادن آن miRNA مي‌باشد.
