بررسي مقايسه‌اي اسيد نوكلئيك استخراج‌شده از باكتري اشريشيا كلاي با دو روش استخراج با فنل-كلروفرم و تكنيك استفاده از نانو ذرات مغناطيسي

مقدمه: از موضوعات مهم پژوهش‌ها در زمينه‌هاي مولكولي و مهندسي ژنتيك، استفاده از روش‌هاي بهينه در استخراج محتواي ژنومي ميكروارگانيسم‌ها و سلول‌ها است كه با استفاده از آن بتوان با صرف كمترين زمان و هزينه، به بيشترين مقدار و مناسب‌ترين خلوص دست‌يافت.روش‌هاي متعددي در راستاي استخراج DNA باكتري‌ها وجود دارد كه از روش‌هاي نوين جداسازي اسيد نوكلئيك مي‌توان به استفاده از نانو ذرات مغناطيسي اشاره نمود. هدف از اين مطالعه، مقايسه دو روش استخراج DNA از باكتري اشريشيا كلاي با دو تكنيك فنل كلروفرم و استفاده از نانو ذرات مغناطيسي است.روش بررسي: در اين مطالعه از باكتري اشريشيا كلاي سويه 25922ATCC جهت مقايسه دو روش استخراج DNA ژنومي استفاده گرديد. جهت استخراج DNA ژنومي از روش فنلكلروفرم و نيز تكنيك استفاده از نانو ذرات مغناطيسي با بكارگيري نانوذره دولايه SiO2/Fe3O4 استفاده گرديد. هر دو محصول به‌دست‌آمده جهت سنجش جذب نوري با دستگاه نانودرآپ قرائت و سپس از طريق روش الكتروفورز روي ژل آگارز بررسي گرديدند.نتايج: در بررسي ميزان جذب نوري با استفاده از دستگاه نانودرآپ ميزان غلظت DNA استخراج‌شده با روش فنل كلروفرم 761.4 ميكروگرم بر ميلي‌ليتر و با استفاده از تكنيك استخراج با نانو ذرات مغناطيسي 531 ميكروگرم بر ميلي‌ليتر به دست آمد. نتيجه‌گيري: با توجه به نتايج به‌دست‌آمده و با مقايسه جذب‌هاي نوري دو محصول و نيز ارزيابي مقايسه‌اي با گروه‌هاي كنترل در استخراج به روش نانو ذرات مغناطيسي و نيز با مقايسه فاكتورهاي مختلفي نظير ميزان زمان موردنياز، هزينه‌ها، كاربري آسان مي‌توان نتيجه گرفت كه به دليل زمانبر و خطرآفرين بودن روش فنل كلروفرم، روش استفاده از نانو ذرات مغناطيسي يك روش مناسب براي استخراج محتوي ژنومي است.