تشخيص باكتري‌هاي كلي‌فرمي، تعيين گروه‌هاي فيلوژني و الگوي مقاومت آنتي‌بيوتيكي اشريشيا كولاي در چشمه‌ها و قنات‌هاي آلوده استان آذربايجان‌شرقي

Detection of coliform bacteria, determination of phylogenetic typing and antibiotic resistance profile of Escherichia coli in qanats and springs of East-Azerbaijan province

اشريشيا كولاي به‌عنوان باكتري شاخص آلودگي مدفوعي آب حائز اهميت است. هدف از اين مطالعه تعيين نوع و فراواني باكتري­هاي كلي‌فرمي و تنوع باكتري­هاي اشريشيا كولاي و تعيين ميزان مقاومت آنتي‌بيوتيكي اشريشيا كولاي جداشده از منابع قنات­ها و چشمه ­هاي آذربايجان­ شرقي مي­باشد. بدين منظور 118 چشمه و قنات انتخاب و به روش MPN مورد بررسي قرار گرفت. نمونه ­هاي كلي‌فرم مثبت به روش‌هاي فنوتيپي و ژنوتيپي شناسايي شدند؛ در مرحله بعد جهت تعيين تنوع ژنتيكي اشريشيا كولاي­ه اي جداشده از روش تعيين تيپ فيلوژني به روش multiplex PCR استفاده شد. جهت تعيين الگوي حساسيت آنتي­بيوتيكي از ديسك­هاي آنتي­بيوتيكي ناليديكسيك­اسيد، كوتريماكسازول، آموكسي­سيلين، جنتامايسين، سيپيروفلوكساسين، كلرامفنيكل، ايميپنم، سفوتاكسيم و سفتازيديم آنتي­بيوگرام استفاده شد طبق نتايج مطالعه. 48% از نمونه­ ها توسط multiplex PCR از نظر كلي‌فرمي مثبت ارزيابي شدند كه 40% اشريشيا كولاي و 19% كلبسيلا تشخيص داده شد. تعلق 23 جدايه به گونه‌ باكتري اشريشيا كولاي تأييد شد. به استناد تعيين گروه‌هاي فيلوژني 44% از سويه‌هاي مورد آزمايش متعلق به گروه B2وD و 56% از سويه­ ها متعلق به گروه A وB1 بودند. نتايج آنتي­بيوگرام، مقاومت مربوط به آموكسي­سيلين را معادل 92% نشان داد. همه­ سويه‌ها نسبت به ايميپينم حساسيت داشتند. حضور سويه‌هاي بيماري‌زاي اشريشيا كولاي با مقاومت بالاي آنتي‌بيوتيكي در منابع آبي مي‌تواند به‌عنوان يك مخاطره بهداشتي براي انسان مطرح باشد.

Escherichia coli as a fecal contamination and is considered as an index in water. The aim of this study was to determine the phenotypic and genotypic characteristics of E. coli and antibiotic resistance of the isolates collected from qanats and springs in East-Azerbaijan province. For this purpose, 118 samples were selected from above mentioned area and examined by MPN method. The positive coliform samples were identified by phenotypic and genotypic methods. Afterwards, to determine the genetic diversity of E. coli isolates, phylogenetic typing we conducted by means of multiplex PCR. To determine the antibiotic resistance profile, antibiotic discs of Nalidixic Acid, Co-trimoxazol, Amoxicillin, Gentamaicin Ciprofloxacin, Chloramphenicol, Imipenem, Cefotaxime and Ceftazidime antibiogram were used. Based on results, 48% of the samples were evaluated as positive for coliform including 40% for E. coli and 19% for Klebsiella. Amongst 23 isolates confirmed as E. coli by PCR. Phylogenetic typing revealed that 44% of E. coli strains belonged to type D and B2 and 56% belonged to A and B1 phylotypes. Antimicrobial susceptibility pattern showed that 92% of E. coli isolates were resistant to Amoxicillin. All E. coli isolates were sensitive to Imipenem. It was concluded that presence of pathogenic E. coli with high rate of antibacterial resistance in waters source could be considered as a human health hazard.