بررسي ارتباط چند‌‌شكلي تك نوكلئوتيدي ژن STAT1 با صفات توليد شير در گاوهاي براون سوئيس

Association of single nucleotide polymorphism of STAT1 gene with milk production traits in Brown Swiss cattle

چند­شكلي تك­نوكلئوتيدي ژن STAT1 با روش PCR-RFLP و ارتباط آن با صفات توليد شير در گاو­هاي شيري نژاد براون­سوئيس بررسي شد. تعداد 98 رأس گاو شيري نژاد براون­سوئيس به طور تصادفي از گاوداري­هاي صنعتي مشهد انتخاب و خون­گيري ازوريد دمي انجام شد. استخراج DNA با استفاده از كيت آماده انجام شد. يك قطعه داراي 314 جفت باز در ناحيه 3'UTR ژن STAT1 با روش PCR تكثير و سپس قطعه مورد نظر توسط آنزيم برشي Pag1 هضم شد. فراواني­هاي ژنوتيپي و ژني با نرم­افزار POPGENE (نسخه 31/1) برآورد شد. براي تجزيه و تحليل آماري از نرم­افزار آماري SAS استفاده شد. ميانگين صفات با روش دانكن مقايسه شد. فراواني ژنوتيپ­هاي TT، TC و CCبه ترتيب 23/0 ، 25/0 و 52/0 بود. فراواني آلل­هاي T و C به ترتيب 355/0 و 645/0 برآورد شد. هتروزيگوسيتي مورد انتظار معادل 0/458 برآورد شد. آزمون مربع كاي نشان داد كه جمعيت مورد مطالعه در تعادل هاردي­وينبرگ نمي­باشد (05/0P<). تفاوت ميانگين الگو­هاي ژنوتيپي در جايگاه ژن STAT1 براي صفات شير (شامل توليد شير، درصد و مقدار چربي شير و مقدار پروتئين شير) معني­دار نبود، ولي براي صفت درصد پروتئين شير معني­دار بود (05/0P<). ميانگين توليد شير و مقادير چربي و پروتئين براي ژنوتيپ CC نسبت به دو ژنوتيپ ديگر بيشتر بود. با توجه به نتايج حاصل، آلل T به عنوان آلل با فراواني كم شناخته مي­شود و وجود آلل C در ژنوتيپ گاو اثر مثبت بر صفات توليد شير، مقدار چربي و پروتئين دارد.

This study was conducted to investigate the Single nucleotide polymorphism of STAT1 gene by PCR-RFLP technique and association of genotypes with milk production traits in Brown Swiss dairy cattle. The blood samples of ninety eight cows were collected randomly from tail vein. The DNA was extracted with Cinagene kit (PR881612C). Fragment of 314 bp of STAT1 gene was amplified by PCR and digested by Pag1 restriction enzyme. Genotype frequencies were calculated by PopGene software (version 1.31). The SAS 9.1 software was used for statistical analysis and the mean of traits was compared by Duncan test. The genotype frequencies of TT, TC and CC were 0.23, 0.25 and 0.52 respectively. The T and C allele frequency were 0.355 and 0.645 respectively. The expected heterozygosity was estimated 0.458. Result of Chi-square showed that the population was not in the Hardy Weinberg equilibrium (P<0.05). The means of traits for milk, percent and yield of fat and yield of protein were not significant but means of percent of protein was significant(P<0.05). The mean of milk, fat and protein yield traits for CC genotype were more than two other genotypes. The results of present study show that the T allele is minor frequency allele and C allele has positive effect on milk, fat and protein yield traits.