بررسي عامل ارثي صرع غير سندرمي اتوزومي مغلوب در يك خانواده‌ي ايراني به روش توالي‌يابي كامل اگزوم

مقدمه: علت بيشتر موارد صرع ناشناخته است و عوامل ارثي مي‌تواند در بروز آن نقش داشته باشد. امروزه، تحقيقات وسيعي در زمينه‌ي علل ايجاد صرع در حال انجام است. هدف از انجام اين مطالعه، شناسايي ژن‌(هاي) عامل صرع غير سندرمي با الگوي توارث اتوزومي مغلوب در يك خانواده‌ي ايراني به روش توالي‌يابي كامل اگزوم بود.روش‌ها: مطالعه‌ي حاضر، از نوع تجربي بود. DNA ژنومي از خون سه فرد مبتلا و يكي از افراد سالم خانواده، استخراج و توالي‌يابي اگزوم با پلت‌فورم Illumina HiSeq 2000 انجام شد. ابتدا، دسته‌بندي واريانت‌ها از نظر نوع، جايگاه جهش و فراواني آللي و سپس، اولويت‌بندي آن‌ها با دو رويكرد انجام شد. توالي‌يابي سنگر براي تأييد واريانت NM_207111.3(RNF216): (g.5780794G A), (c.854C T) ژن RNF216 انجام شد.يافته‌ها: از 130855 واريانت، حدود 85 درصد از نوع تغييرات تك نوكلئوتيدي و 15 درصد از نوع indels بودند. يك سوم تغييرات در نواحي بين ژني و اينتروني، يك سوم در 3’,5’UTR و يك سوم در نواحي اگزوني و جايگاه پيرايش بودند. از نظر فراواني آللي در پايگاه داده‌ي ExAC و 1000 ژنوم، به ترتيب 3.8 درصد و 3.4 درصد واريانت‌ها، فراواني آللي كمتر از 01/0 داشتند. با اعمال هر دو رويكرد، واريانت NM_207111.3(RNF216): (g.5780794G A), (c.854C T) ژن RNF216 به عنوان كانديدا شناسايي شد، اما ارتباط اين واريانت در همه‌ي اعضاي خانواده تأييد نگرديد.نتيجه‌گيري: توالي‌يابي اگزوم به ابزاري جهت مطالعه‌ي عوامل ژنتيكي بيماري‌هاي مندلي تبديل شد، اما با محدوديت‌هايي نيز همراه بود. در صورت قرار گرفتن واريانت در نواحي غير كد شونده‌ي ژنوم، هتروژني كلينيكي، تشخيص نادرست بيماري، فنوكپي، محدوديت‌هاي تكنيكي و آناليز واريانتي، مي‌توانند موانعي براي شناسايي واريانت عامل بيماري محسوب شوند كه باعث عدم موفقيت در شناسايي ژن عامل بيماري در اين خانواده شده‌اند.