شيوع ژن tir در سويه E. coli جدا شده از مواد غذايي سرد

Prevalence of tir Gene in E. coli Strain Isolated from Cold Foods

مقدمه: E . coli ساكن طبيعي مجراي روده انسان و حيوانات خون گرم است. اين باكتري از طريق انتقال مدفوعي دهاني ممكن است به غذاهاي سرد مانند: سالاد، ساندويچ هاي سرد كه حرارت داده نمي شوند منتقل شود و ديگران را آلوده كند به همين علت، يافتن راهي سريع براي شناسايي اين باكتري در مواد غذايي سرد مانند: سالاد، ساندويچ هاي سرد كه حرارت داده نمي شوند ضروري است. روش كار: در اين پژوهش با استفاده از محيط هاي كشت غني كننده و افتراقي (مانند محيط نوترينت براث و محيط مك كانكي آگار و EMB آگار) و انجام آزمايشات بيوشيميايي (تست تخمير قندها، حركت، اندول و... ) و همچنين با استفاده از روش مولكولي PCR مشخص شد كه از بين 100 نمونه مواد غذايي سرد ( از جمله: كاهو، كالباس، كلم و گوجه) جمع آوري شده فقط 25 نمونه (25%) داراي باكتري E . coli و وجود ژن tir در اين باكتري بودند كه اين امر نشان دهنده وجود باكتري E . coli بيماريزا در 25% مي باشد. يافته ها از بين 100 نمونه مواد غذايي سرد ( 25 =كاهو، 25 كالباس، 25 گوجه، 25 =كلم) جمع آوري شده، پس از كشت نمونه ها در محيط هاي افتراقي و انجام آزمايش PCR و همچنين آزمايش PCR مستقيم مشخص شد كه فقط باكتري هاي E. coli جدا شده از 25 نمونه (25% ) كالباس ها داراي ژن tir هستند. در واقع نتايج حاصل از كشت و بدون كشت (بطور مستقيم) در PCR مشابه بوده است و در PCRاز نمونه هاي حاصل از كشت و بدون كشت، 25٪ ژن tir مشاهده شده است. نتيجه گيري: اين مطالعه نشان داد كه با استفاده از روش PCR مستقيم مي توان ژن tir را در مواد غذايي سرد مانند: سالادها و ساندويچ هاي سرد در مدت زمان كمتري (24 ساعت) نسبت به كشت نمونه ها شناسايي كرد. وجود ژن tir، در نمونه هاي جمع آوري شده، نشان دهنده بيماريزا بودن باكتري اشريشيا كلي است. بنابراين، شناسايي سريع اين ژن از طريق روش مولكولي PCR مستقيم مي تواند باكتري اشريشيا كلي بيماريزا را متمايز كند.

Background and objective E. coli resides in natural intestinal tract of human and warm blooded animals. This bacteria can be transferred (fecal, oral) into cold foods like salad, cold sandwich that are not heated and infect other people. Materials and methods In this research, using enriched and isolated culture media (e.g. nutrient broth and MacConkey agar and EMB agar) and performing biochemical experiments (e.g. sugars fermentation, movement and Andole and etc.) as well as molecular method PCR, it was cleared that only 25 samples out of collected 100 cold food samples (e.g. lettuce, sausage, cabbage and tomato) had E. coli bacteria and tir gene in this bacterium have tir gene suggesting that pathogenic bacteria E. coli is in 25 (25%) samples. Results From between collected 100 cold food samples (25 lettuce, 25 sausage, 25 cabbage and 25 tomato) cultured samples in the isolated culture media and Direct PCR experiment indicated that just 25 samples (25%) sausage have tir gene. Samples sausage have tir gene. In fact, the results of cultivation and without cultivation (directly) were similar in PCR and in PCR from samples from cultivation and without cultivation, 25% tir gene has been observed. Conclusion This research indicated that the gene tir can be identified using direct PCR in cold foods used in cold sandwich and salads in a shorter time (24 h) compared to cultures in isolated media and biochemical experiments. The presence of tir in the collected samples indicates the pathogenicity of the bacterium E. coli. Therefore, earlier identification of this gene through molecular method PCR can result in distinguished pathogenic Escherichia coli.