مطالعه كمّي ميزان بيان lncRNA HOX A11As در بيماران ايراني مبتلابه گليوبلاستوما

Investigation of Long Non-coding RNA HOX A11-AS Expression in Iranian Patients with Glioblastoma: A Quantitative Study

زمينه و هدف: گليوبلاستوما يكي از بدخيم‌ترين و رايج‌ترين تومورهاي مغزي است كه حدود نيمي از گليوماها را به خود اختصاص مي‌دهد. گليوبلاستوما يكي از تومورهاي سيستم عصبي مركزي (CNS: Central Nervous System) است كه از بافت گليال مغز نشئت مي‌گيرد. هدف از اين مطالعه بررسي تغييرات بيان lncRNA HOXA11-AS به‌عنوان بيوماركر احتمالي در گليوماست. روش بررسي: بدين منظور پس از بررسي پرونده پزشكي بيماران بيمارستان امام حسين تهران، گرفتن رضايت‌نامه كتبي از بيماران و گرفتن كد اخلاق اين پژوهش در بيمارستان امام حسين انجام شد. بلوك‌هاي پارافينه شامل بيوپسي بافت توموري مغز از سال 1394 تا 1396 جمع‌آوري شد و متخصص پاتولوژيست آن‌ها را تأييد و تعيين درجه كرد. در اين پروژه، 50 نمونه درجه 1 و2 و 50 نمونه درجه 3 و4 بررسي شد. براي تمام نمونه‌هاي بافتي اهداشده بيماران، استخراج RNA و سنتز cDNA صورت گرفت. سپس پرايمر و پروب اختصاصي طراحي و ميزان بيان ژن HOXA11-AS با استفاده از روش Real-time PCR بررسي شد. ميانگين سن افراد بررسي‌شده 416/16 ± 70/43 سال بود. تجزيه‌وتحليل آماري داده‌ها به‌صورت توصيفي و تحليلي با استفاده از نرم‌افزار SPSS نسخه 20 انجام شود. همچنين براي مقايسه ميزان بيان اين ژن در بافت تومورال با درجه پايين‌تر و بافت تومورال با درجه بالاتر از آزمون آماري تي مستقل استفاده شد. يافته‌ها: نتايج نشان داد نمونه‌هاي توموري با درجه سه و چهار، 76/2 برابر نمونه‌هاي توموري با درجه يك و دو افزايش بيان (fold change) داشتند كه ازنظر آماري اين فاصله معني‌دار است. نتيجه‌گيري: نتايج بررسي كمّي نشان داد بيان ژن HOXA11-AS افزايش معني‌داري با افزايش درجه بيماري دارد (0002/0P=).

Background and Objectives: Glioblastoma is one of the most malignant and common brain tumors, accounting for about half of all gliomas. Glioblastoma is a central nervous system tumor that originates from the glial tissue of the brain. The present study aimed to investigate changes in the expression of long non-coding RNA HOXA11-AS as a possible biomarker in glioma. Methods: For the purposes of the present study, first, the medical records of the patients in Imam Hossein Hospital in Tehran, Iran were reviewed. The ethical considerations were respected as well; accordingly, written informed consent was obtained from the patients and the code of ethics was achieved as well. Finally, the paraffin blocks, including the biopsy of brain tumor tissue of the patients who referred to Imam Hossein Hospital during 2015-17 were collected and their degrees were confirmed by the pathologist. In total, 50 samples of grades 1 and 2 as well as 50 samples of grades 3 and 4 were examined in this research project. The RNA extraction and cDNA synthesis were performed for all the tissue samples donated by the patients. Subsequently, a specific primer and probe were designed and the expression of the HOXA11-AS gene was investigated using real-time polymerase chain reaction technique. The mean age of the subjects was 43.70±16.416 years. The collected data were analyzed in SPSS software (version 20) using descriptive and analytical statistics. Moreover, the expression levels of this gene in lower- and higher-grade tumor tissues were compared using the unpaired samples t-test. Results: Based on the results, the tumor samples with grade three and four underwent a 2.76 fold increase in expression (fold change), compared to tumor samples with grade one and two. This difference was statistically significant. Conclusion: Based on the findings, it can be concluded that the expression of the HOXA11-AS gene has a significant positive relationship with the degree of disease (P=0.0002).