بررسي تنوع ژنتيكي برخي ارقام مركبات شمال ايران با استفاده از نشانگرهاي مولكولي ريز ماهواره

The Genetic Diversity of Some Citrus Varieties from North of Iran Using Microsatellite Molecular Markers

در اين مطالعه تنوع ‌ژنتيكي 29 رقم مركبات شامل ارقام پرتقال، نارنگي، نارنج، پوملو و تيپ‌هاي طبيعي با استفاده از هشت جفت آغازگر ريز ماهواره‌اي مورد ارزيابي قرار گرفت. DNA ژنومي استخراج شده از نمونه-هاي گياهي با اين آغازگرها تكثير و محصولات حاصل با استفاده از ژل پلي اكريل آميد الكتروفورز شدند. از مجموع 97 باند امتيازدهي شده براي نشانگر ISSR، تعداد 78 باند معادل 22/80 درصد باندها چند شكل بودند. بيشترين و كمترين درصد چند شكلي به‌ترتيب آغازگرهاي ISSR-8 با 90% و ISSR-5 با 73% باند، چند شكل نشان دادند. متوسط مقدار PIC در اين آزمون 18/0 بود. بيشترين مقدار PIC براي آغازگرهاي ISSR-6 وISSR-8 با 27/0 و كمترين ميزان براي آغازگر ISSR-1 با 12/0 گزارش شد. بر اساس اين مطالعه، دندروگرام حاصل از تجزيه خوشه‌اي به‌ روش UPGMA با ضريب تشابه تطابق ساده، ارقام مورد بررسي به پنج گروه اصلي طبقه بندي شدند. در اين بررسي، پوملو در خوشه‌اي مجزا قرار گرفت. بر اساس نشانگر مولكولي ISSR ، نارنگي انشو سوجي ياما و كلمانتين نولس را در دو گروه مجزا قرار گرفتند. بنابراين، اين نشانگر مولكولي سطوح مختلفي از تنوع را در سطح ژنوم ارايه مي‌دهد كه مي‌تواند در مديريت ژرم ‌پلاسم و ذخاير توارثي مفيد باشد. تجزيه تنوع ژنتيك و روابط خويشاوندي در مركبات، اطلاعات مفيدي را براي برنامه-هاي اصلاحي، انتخاب و ثبت ارقام جديد فراهم مي‌كند.

The genetic diversity of 29 varieties of citrus, including varieties of orange, mandarin, bergamot, pomelo, and natural types through using eight microsatellite primers were evaluated. Genomic DNA extracted from the samples using the amplification was reproduced and products using polyacrylamide gel were electrophoresed. A total of 97 bands were scored for marker ISSR, 78 bands were polymorphic bands of 80.22 percent. The highest and the lowest percentage of polymorphic were ISSR-8 primers with 90% and polymorphic ISSR-5 with 73% band, respectively. The average value of PIC was 0.18 in this test. The most of the PIC was reported by primer ISSR-6 and ISSR-8 with 0.27 and the lowest primer was also reported by ISSR-1 with 0.12. Based on the study, dendrogram of cluster resulted from the analysis of UPGMA method with simple matching coefficient; the cultivars were classified into five main groups. In this study, Pomelo was in a separate cluster. The ISSR molecular marker of Satsuma mandarin and clementine Suji Yama were grouped into two distinct groups. Therefore, this molecular marker presents the different levels of diversity at the genome level which can be useful in germplasm management and hereditary stocks. Genetic diversity analysis and kinship relationships in citrus provide useful information for breeding programs, selection, and registration of new varieties.