تنوع توالي هاي تكرار شونده در ايزوله هاي سالمونلا انتريكا سروار اينفانتيس جدا شده از نمونه هاي باليني

Diversity of Variable Number of Tandem Repeats in Salmonella enterica Serovar infantis Isolated from Clinical Samples

سابقه و هدف: باكتري سالمونلا، يك پاتوژن روده اي و عامل شايع مسموميت هاي غذايي در دنياي امروز است. در طي سال هاي اخير، عفونت هاي ناشي از سالمونلا انتريكا سروار اينفانتيس به سرعت رو به افزايش است. توالي هاي تكرار شونده پُشتِ سرِ هَم ، الگوهايي از DNA هستند كه در تمامي پروكاريوت ها وجود دارند. اين توالي ها ممكن است از نظر تعداد واحدهاي تكراري، در بين سويه هاي مختلف يك گونه، متفاوت باشند. بنابراين، اهداف مناسبي جهت تمايز ايزوله هاي مختلف يك گونه هستند. هدف از اين مطالعه، تعيين تنوع دو توالي هاي تكرار شونده در ايزوله هاي سالمونلا انتريكا سروار اينفانتيس جدا شده از نمونه هاي باليني در شهر تهران بود. روش كار: در اين مطالعه، تعداد 20ايزوله سالمونلا انتريكا سروار اينفانتيس جدا شده از بيماران، كه با استفاده از تست هاي بيوشيميايي معمول تأييد شدند، از نظر توالي هاي تكرار شونده بررسي شدند. با استفاده از روش واكنش زنجيره اي پليمراز (PCR) توالي هاي تكرار شونده تكثير داده شد و پس از الكتروفورز بر روي ژل آگارز، تعداد تكرارهاي هر لوكوس ، تعيين شد. يافته ها: نتايج PCRبا استفاده از پرايمرهاي اختصاصي در مورد توالي هاي تكرار شونده در باكتري سالمونلا اينفانتيس نشان داد كه لوكوس SENTR3داراي بيش ترين تنوع اللي و لوكوس SE4داراي كم ترين تنوع اللي بود. نتيجه گيري: با توجه به تنوع نسبتاً بالاي لوكوس هاي مورد مطالعه، ميتوان از اين لوكوسها جهت ژنوتايپينگ و بررسي قرابت ژنتيكي ايزوله هاي مختلف سالمونلا اينفانتيس در مطالعات اپيدميولوژيكي استفاده كرد.

Background an‎d Objective Salmonella is a gastrointestinal pathogen with a widespread distribution throughout the word. This pathogen is considered as one of the most common and current foodborne infection in the world. The increasing incidence of infections caused by Salmonella enterica serovar infantis is concerning. Variable number tandem repeats are patterns of the repeated DNA which may have different repeats or sizes among different strains of a particular genus. The purpose of this study to assess the diversity of Salmonella enteric serovar infantis strains isolated from the clinical samples in Tehran. Materials an‎d Methods A total number of 20 strains of Salmonella enterica serovar infantis were analyzed by PCR with specific primers designed for SENTR3 and SE4 loci. Diversity of each loci were assessed after gel electrophoresis. Results The results demonstrated that SENTR3 locus showed the highest number of alleles, while the locus of SE4 showed the least number of alleles. Conclusion Since these loci showed relatively high diversity, these loci can be used as useful markers for genotyping of Salmonella enterica serovar infantis isolates in epidemiological surveys.