ترانسكريپتوميكس و روش هاي پر كاربرد بررسي بيان ژن‌هاي دفاعي گياه

Transcriptomics and useful techniques of defense gene expression evalution of plant

ترانسكريپتوميكس يكي از زمينه‌هاي پيشرفته در زمينۀ علوم بعد از ژنوميك است. علم ترانسكريپتوميكس بر روي ميزان بيان ژن‌ها با بررسي سطوح RNA تمركز مي‌كند. ترانسكريپتوميكس اطلاعات زيادي را در مورد ژنوم، ساختار ژن‌‌ها و عملكرد ژن‌ها فراهم مي-آورد و با استفاده از اين اطلاعات مكانيسم‌هاي مولكولي كه در فرايندهاي بيولوژيكي مختلف سلولي رخ مي دهد آشكار مي‌شود. گياهان بعد از درك بيمارگر سيستم دفاعي خود را فعال مي‌كنند. امروزه ترانسكريپتوميكس كاربرد وسيعي در كشاورزي پيدا كرده و با استفاده از اين علم پاسخ به تنش‌هاي زيستي و غيرزيستي، بيماري‌هاي انباري و شناسايي ارقام مقاوم در بيماري شناسي گياهي مطالعه مي-شود. بررسي بيان ژن‌ها در زمان تنش و شناسايي ژن‌هاي دفاعي نسبت به بيمارگرها، بسيار ضروري است. نتايج تحقيقات ترانسكريپتوميكس در مورد بيان ژن، اطلاعات مرتبط به مكانيسم تحمل و مقاومت به بيمارگرهاي گياهي را افزايش داده و توليد ارقام مقاوم و متحمل از راه روش‌هاي زيست فناوري را هموارتر مي سازد. روش‌هاي مختلفي جهت تجزيه پروفايل بيان ژن در گياهان وجود دارد. روش‌هايي كه براي مطالعۀ بيان ژن‌ها مورد استفاده قرار مي‌گيرد به سه دستۀ روش‌هاي متكي بر هيبريداسيون، روش‌هاي مبتني بر PCR و روش‌هاي متكي بر توالي يابي تقسيم مي‌شوند. در اين مقاله مروري بر روش هاي مطالعۀ بيان ژن‌ها و كاربردهاي آن در بيماري شناسي گياهي پرداخته مي شود.

Transcriptomics is one of the most developed branches in the post-genomic era. Transcriptomics focuses on the gene expression at the RNA level and shows the genome wide information of gene structure and gene function in order to reveal the molecular mechanisms involved in specific biological processes. The plant activate the defense system after detect plant pathogens. Recently, transcriptomics has found wide application in agriculture, this knowledge are used for studing the biotic and abiotic stresses, storage diseases and the identification of resistant cultivars. It is essential the gene expression in times of stress. Transcriptomics studies of gene expression increase the information on the mechanisms of tolerance and resistance to plant disease. There are several techniques for analysis of gene expression profiles in plants. The methods used to study gene expression is placed into three categories based on hybridization techniques, techniques based on PCR and sequencing-based techniques can. In this article, it was review on methods to study gene expression and the its application in plant pathology.