اشتباه در شناسايي باكتري هاي بيماري زاي معمول در آزمايشگاه يك بيمارستان دانشگاهي

Misidentification of Common Pathogenic Bacteria in a University Hospital Laboratory

سابقه و هدف: شناسايي دقيق و قطعي باكتري هاي بيماري زا، جهت تشخيص صحيح بيماري، درمان عفونت و رديابي شيوع بيماري هاي مرتبط با عفونت هاي ميكروبي ضروري است. استافيلوكوكوس اپيدرمايديس بخشي از فلور طبيعي بدن انسان است و همچنين به عنوان يك بيماري زاي فرصت طلب نيز شناخته مي شود. اين باكتري مهمترين عامل ايجاد عفونت هاي مرتبط با ابزارهاي مصنوعي محسوب مي شود. اشرشيا كلاي، فلور طبيعي روده انسان و حيوانات است و فراوانترين باكتري عامل ايجاد عفونت هاي معمول دستگاه ادراري است. هدف اين مطالعه، ارائه ميزان اشتباه در شناسايي دو باكتري معمول در يك بيمارستان دانشگاهي در اصفهان است. روش كار: در طي دي ماه 1393لغايت آذر ماه 1394تعداد 284جدايه اشرشيا كلاي و 135جدايه استافيلوكوكوس اپيدرمايديس از آزمايشگاه يك بيمارستان دانشگاهي در اصفهان جمع آوري گرديدند. تمامي جدايه ها در آزمايشگاه با استفاده از آزمونهاي معمول بيوشيميايي و آزمون PCRبا استفاده از پرايمرهاي اختصاصي مجددا مورد شناسايي قرار گرفتند. يافته ها: در مجموع نتايج حاصل از آزمونهاي فنوتيپي و ژنتيكي در آزمايشگاه منطبق بر يكديگر بودند، اما اين نتايج با شناسايي سويه ها در بيمارستان مغاير بودند. بر اين اساس، مشخص گرديد كه 55جدايه ( 19/4درصد) اشرشيا كلاي و 28جدايه ( 20/7درصد) نيز استافيلوكوكوس اپدرمايديس نبودند. نتيجه گيري: تشخيص صحيح و مناسب باكتريهاي بيماريزا، استفاده از روشهاي اجرايي استاندارد (SOP) در آزمايشگاههاي تشخيص طبي و ارائه دستورالعمل هاي مفيد درماني مي تواند بهترين كمك به پزشكان جهت حذف و ريشه كني عفونتها از بيمارستان ها و جامعه باشد.

Background an‎d Objective Accurate and definitive identification of pathogenic bacteria is essential for correct disease diagnosis, treatment of infection and trace-back of disease outbreaks associated with microbial infections. Staphylococcus epidermidis is a part of the human normal microbiota and known as opportunistic pathogen. This bacterium is the most important cause of indwelling device-related infections. Escherichia coli as a member of human and animal gut flora, is the most commonly isolated pathogen from uncomplicated urinary tract infections as well as catheter-associated urinary tract infections. The aim of this study is to report the rate of misidentification of two common bacteria in a university hospital in Isfahan. Materials an‎d Methods During December 2014 and November 2015, a total of 284 E. coli and 135 S. epidermidis strains were collected from a university hospital laboratory in Isfahan. All isolated were identified using standard biochemical tests and PCR by specific primers. Results The results of phenotypic and genetic testing in the laboratory were consistent with each other, but were not in agreement with results of bacterial identification in the hospital. Therefore, the results showed that 55 (19.4%) and 28 (20.7%) of strains were not E. coli and S. epidermidis, respectively. Conclusion Accurate and definitive identification of pathogenic bacteria, using standard operating procedures (SOP) in medical laboratories and providing useful therapeutic guidelines can help clinicians to remove and eradicate infections from the hospitals and community.