شناسايي مولكولي لاكتوباسيل هاي جدا شده از پنيرهاي سنتي شهرستان بندرعباس

Molecular identification of lactobacilli isolated from traditional cheeses of Bandar Abbas city

سابقه و هدف: لاكتوباسيل‌ها ارگانيسم‌هايي گرم‌مثبت، كاتالاز منفي، بدون اسپور و ميله‌اي شكل هستند. تاكنون بيش از 90 گونه از اين باكتري‌ها شناخته شده است. سوش‌هاي متعددي از لاكتوباسيل‌هاي پروبيوتيك در طيف وسيعي از محصولات غذايي انسان وجود دارد. شناسايي اين باكتري‌ها در محصولات لبني سنتي، امكان استفاده از آن­ها را در توليد فرآورده‌هاي لبني صنعتي مطبوع‌تر فراهم مي ­آورد. انتخاب روش ­هاي قابل‌اطمينان، براي شناسايي لاكتوباسيل‌ها از اهميت خاصي برخوردار است. روش‌هاي بيوشيميايي ‌وقت ­گير و ابهام‌آميز هستند. روش‌هاي مولكولي، مناسب‌تر و دقيق‌تر بوده و مي ­توانند جايگزين روش­ هاي قبلي شوند. هدف از اين تحقيق، جداسازي لاكتوباسيل‌ها از فلور موجود در پنير سنتي شهرستان بندرعباس و شناسايي آن­ها با استفاده از روش مولكولي PCR به ­عنوان يك ابزار مؤثر در شناسايي سويه‌هاي جدا شده است. مواد و روش­ ها: تعداد 50 نمونه پنير سنتي از شهرستان بندرعباس جمع­ آوري و سويه‌هاي لاكتوباسيل توسط روش‌هاي فنوتيپي جدا شدند. براي شناسايي مولكولي آن­ها، از پرايمرهاي 16s rRNA استفاده گرديد. سپس محصول PCR جهت توالي­يابي به شركت پويا ژن گستر ارسال شد. توالي‌هاي به‌دست‌آمده در بانك ژني NCBI بلاست شدند. يافته ­ها: در مجموع 3 سويه لاكتوباسيل شامل لاكتوباسيلوس پلانتاريوم (Lactobacillus plantarum)، لاكتوباسيلوس هلوتيكوس (Lactobacillus helveticus) و لاكتوباسيلوس مورينوس (Lactobacillus murinus) شناسايي شد. نتيجه ­گيري: اين سه سويه كيفيت محصولات لبني اين منطقه را تأمين نموده و پتانسيل كاربرد در محصولات توليد شده در صنعت را دارا هستند.

Aim and background Lactobacilli are Gram-positive, catalase-negative, non-spore forming, rod-shaped organisms. So far, more than 90 species of these bacteria have been identified. There are several strains of probiotic Lactobacilli in a wide range of human food products. Identification of these bacteria in traditional dairy products makes it possible to use them in the production of delicious industrial dairy products. The selection of reliable methods for the identification of Lactobacilli is of a particular importance. Biochemical methods are time consuming and ambiguous. Molecular methods are more appropriate and precise and can be a substitute for previous methods. The purpose of this study is the isolation of Lactobacilli from bacterial flora in Bandar Abbas traditional cheese and identification these bacteria by using PCR as an effective tool for the recognizing the isolated strains. Materials and methods Fifty samples of traditional cheese were collected from Bandar Abbas and strains were obtained by phenotypic methods.16 s rRNA primers were used to identify their molecular identity. Then the PCR product was sent to Poya Gene Gostar for sequencing. Obtained sequences were blasted in NCBI GenBank. Results 3 strains of Lactobacillus include Lactobacillus murinus, Lactobacillus helviticus and Lactobacillus planatrum were identified. Conclusion These three strains improve the quality of dairy products in this area and can be used in products manufactured in the industry.