كليدواژه :
تنوع ژنتيكي , گندم دوروم , تنش خشكي , ماركرهاي SSR , گزينش به كمك ماركرها
چكيده فارسي :
به منظور بررسي گزينش به كمك ماركرها و همچنين شاخص تحمل به تنش خشكي (STI). 20 رقم گندم دوروم با استفاده از طرح اسپليت پلات در قالب كاملا تصادفي كشت، و اجزاء عملكرد محاسبه شد. در سطح مولكولي از 20 جفت آغازگر (SSR) جهت بررسي تنوع ژنتيكي بين ارقام و تعيين ژنوتيپهاي متحمل به تنش خشكي استفاده گرديد. پس از استخراج DNA و تعيين كميت و كيفيت آن، PCR به روش Touch down صورت گرفت. در مجموع 58 آلل از 20 لوكوس شناسايي گرديد. بيشترين آلل متعلق به Xgwm601 و Xbarc108با چهار آلل و كمترين آن با دو آلل متعلق به ماركرهاي Xgwm413، Xgdm132، Xwmc48، Xbarc40، Xbarc121 و Xgwm375 بود. ميانگين آلل توليد شده براي هر لوكوس در اين تحقيق 9/2 آلل است. امتيازبندي و طول قطعات توليد شده با استفاده از نرم افزار UVDOC مشخص گرديد. ماتريس تشابه، تجزيه كلاستر به روش UPGMA و نيز رسم دندروگرام همگي با استفاده از نرم افزار NTSYS انجام گرفت. معيار آماري ضريب همبستگي كوفنتيك نيز محاسبه و عدد 86% بدست آمد. دندروگرام، نشان دهنده دو كلاستر، در يك كلاستر ژنويپهاي شماره يك، 2، 15، 16، 20، 13، 3، 4، 19، 8، 12، 7، 9، 5 و 14 و در كلاستر ديگر ژنوتيپهاي شش، 18، 10، 17 و 11 قرار دارند. ژنوتيپهاي 5 و 14 از شاخص تحمل به تنش بالاتري نسبت به ساير ارقام برخوردارند. نتايج نشان داد خصوصيت چند آللي يك پديده كاملاً متداول و معمول در ماركرهاي SSR ميباشد كه بيانگر پيوستگي صفات يا تاثير ژنهاي چند اثره ميتواند باشد.
چكيده لاتين :
To evaluated of efficiency of selection by markers (MAS). 20 genotypes durum wheat was conducted as a split plot design in randomized complete block are planted and yield components calculated. Also in molecular level of 20 pair starter (SSR) to study genetic diversity between varieties and determine genotypes tolerant to drought stress was used. After extraction of DNA and appointment that quantity and quality polymerase chain reaction took place in the touch down method. In total 58 allele of the 20 locus was detected. The largest allele detected belonged to the Xgwm610, and Xbarc108 with 4 allele and the lowest with 2 allele was reserved markers Xgwm413, Xgdm132, Xwmc48, Xbarc40, Xbarc121, Xgwm375. Average allele produced for each locus in this research is 2/9. Rating and length of the parts produced using the software UVDOC was specified. Similarity matrix, the cluster analysis in UPMMA method and draw dendrogram using NTSYS software took. Standard correlation coefficient of cophentic calculated and the number of 0/86 was obtained. Dendrogram represent 2 cluster of quite distinct. In one cluster the number of genotypes 1, 2, 15, 16, 20, 13, 3, 4, 19, 8, 12, 7, 9, 5, 14 and in another cluster the number of 6, 18, 10, 17, 11 are placed. Genotypes of 5 and 14 of higher stress tolerance index than other varieties. The result showed multiple allele trait a phenomenon quite usual and common in markers (SSR) continuity of trait or could be effect of the multiple genes.