تعيين فراواني پلي‌مورفيسم‌هاي ژن فوكوزيل ترانسفراز 3 در اهداكنندگان ايراني

ژن FUT3 ، بيان آنتيژنهاي گروه خوني لوئيس از جمله Lea و Leb را تنظيم مي‌كند. افرادي كه آنتيژنهاي گروه خوني لوئيس را نمي‌سازند، هاپلوتايپ‌هايي با پليمورفيسمهاي تك نوكلئوتيدي غير فعال‌كننده آنزيم دارند كه فراواني آن‌ها در بين نژادهاي مختلف متفاوت است. در مطالعه حاضر، فراواني اين پليمورفيسمها در اهداكنندگان ايراني مورد بررسي قرار گرفت. مواد و روش‌ها در اين مطالعه مقطعي- توصيفي، 100 نفر از اهداكنندگان مراجعهكننده به پايگاه انتقال خون تهران در سال 1396 مورد بررسي قرار گرفتند. از PCR و DNA sequencing براي تعيين پليمورفيسمهاي تك نوكلئوتيدي ژن لوئيس استفاده شد. هاپلوتايپها نيز توسط نرم افزار SNP Analyzer مشخص شدند. يافته‌ها در مجموع 15 پليمورفيسم شناسايي شد كه از اين تعداد 10 مورد مرتبط با موتاسيونهاي missense بودند. فراواني مهمترين پليمورفيسمهاي شناسايي شده عبارتند از: 202T>C 39%، 314C>T 37%، 59T>G 20% ، 508G>A 9% و 47G>C 8% . هم چنين 13 هاپلوتايپ نيز شناسايي شد كه فراواني مهمترين هاپلوتيپها عبارتند از: Le 2/66%، le202,314 5/17%، le47,202,314 3/4%، le59 1/4% و le59,508 4/3% . نتيجه گيري بر اساس اين پژوهش، پليمورفيسمهاي 202T>C، 59T>G و 508G>A ميتوانند به عنوان SNP هاي اصلي براي شناسايي آللهاي لوئيس منفي در تعيين ژنوتيپ گروههاي خوني لوئيس و مطالعه‌هاي مرتبط با بيماريها مفيد واقع شوند.

Background and Objectives The FUT3 gene regulates the expression of Lewis blood group antigens mainly Lea and Leb. The Lewis negative phenotype, is the result of an inactivated FUT3 enzyme that lacks glycosidase activity. Several single nucleotide polymorphisms (SNPs) may cause enzyme inactivation with different racial distribution. This study aimed to determine the frequency of these SNPs in Iranian blood donors. Materials and Methods In this cross sectional descriptive study, one hundred blood donors from Tehran Blood Transfusion Center were analyzed. Genomic DNA was extracted and the coding sequence of FUT3 gene was amplified with specific primers. PCR products were directly sequenced. Haplotypes were inferred by SNP Analyzer software. Results A total of 15 SNPs including 10 nonsense SNPs were recognized. The frequency of most common SNPs was detected as 39%(202T>C), 37%(314C>T), 20%(59T>G), 9%(508G>A), and 8%(47G>C). Haplotype analysis revealed 13 haplotypes. The frequency of major haplotypes was detected as 66.2%(Le), 17.5%(le202,314), 4.3 %(le47,202,314), 4.1 %(le59), and 3.4%(le59,508). Conclusions Our findings indicate that 202T > C, 59T > G and 508G > A are useful as major SNPs for detection of Lewis-negative alleles in genotyping of Lewis blood groups; they can also play an effective role in large-scale studies associated with diseases in our population.