عنوان مقاله :
بررسي الگوي بياني خانواده فاكتورهاي رونويسي شوك حرارتي (HSFs) در گياه آلوروپوس ليتوراليس تحت تنش شوري
پديد آورندگان :
هاشمي پطرودي ، حميدرضا دانشگاه علوم كشاورزي و منابع طبيعي ساري - پژوهشكده ژنتيك و زيست فناوري كشاورزي طبرستان - گروه مهندسي ژنتيك و بيولوژي , نعمت زاده ، قربانعلي دانشگاه علوم كشاورزي و منابع طبيعي ساري - پژوهشكده ژنتيك و زيست فناوري كشاورزي طبرستان - گروه مهندسي ژنتيك و بيولوژي , محمدي ، سميرا دانشگاه علوم كشاورزي و منابع طبيعي ساري , كولمن ، ماركوس مؤسسه ژنتيك گياهي و تحقيقات گياهان زراعي ليبنيز (IPK) - گروه ژنتيك مولكولي
كليدواژه :
آناليز ترانسكريپتوميكس , آناليز موتيفهاي پروتئيني , پروتئينهاي شوك حرارتي , ساختار ژني
چكيده فارسي :
فاكتورهاي شوك حرارتي (Heat Shock Factors)، نقش مهمي در پاسخ به تنشهاي زيستي و غيرزيستي در يوكاريوتها ايفا مينمايند. هدف از اجراي اين تحقيق، شناسايي ژنهاي فاكتور رونويسي AlHSF در گياه هالوفيت آلوروپوس ليتوراليس (Aeluropus littoralis) ميباشد. بدين منظور شناسايي و تعيين مشخصهسازي ژنها، ساختار ژني، آناليز موتيفهاي پروتئيني و روابط فيلوژنتيكي خانواده ژني AlHSF مدنظر قرار گرفت. آناليز الگوي بيان اين ژنها در دو بافت برگ و ريشه، تحت شرايط تنش شوري و شرايط ريكاوري، با استفاده از دادههاي RNAseq صورت پذيرفت. بر اساس تواليهاي ژنومي A. littoralis، 11 ژن AlHSF غيرتكراري و منحصربفرد شناخته شدند. تمام 11 فاكتور رونويسي AlHSFs، بر اساس همولوژي با آرابيدوپسيس، به سه دسته (A، B و C) تقسيم شدند. بر اساس دادههاي RNAseq، الگوي بيان ژنهاي AlHSF در بافتهاي برگ و ريشه تحت شرايط تنش شوري و ريكاوري، متفاوت بود. سطح بيان متفاوت اين ژنها، ميتواند به عملكردهاي مولكولي و مكانيسمهاي تنظيمي متفاوت در كنترل فعاليت اين ژنها مرتبط باشد. يافتههاي اين تحقيق، ضمن ارائه خصوصيات عملكردي ژنهاي AlHSF، پايهاي براي تحقيقات كاربردي آينده در مورد نقش بيولوژيكي آنها در تحمل گياه آلوروپوس ليتوراليس به تنشهاي زيستي و غيرزيستي، فراهم مينمايد.
عنوان نشريه :
تنشهاي محيطي در علوم زراعي
عنوان نشريه :
تنشهاي محيطي در علوم زراعي