مقايسه كمي زوج درخت‌هاي حاصل از درخت‌هاي فيلوژنتيكي ژن و پروتئين براي آنزيم سولفيت ردوكتاز فلاووپروتئيني آلفا، درخت‌هاي 5SrRNA و تاكسونومي در گونه‌هاي منتخب باكتريايي

مقدمه: خانواده پروتئيني FAD-FR داراي كوفاكتور FAD مي‌باشد. يكي از آنزيم‌هاي مهم اين خانواده سولفيت ردوكتاز فلاووپروتئيني آلفا مي‌باشد. هدف اين مطالعه توجه به كاربرد‌هاي اين آنزيم در بيوتكنولوژي و صنعت اين آنزيم در 19 گونه مشخص در ارتباط با تكامل است. روش: توالي‌هاي ژن و پروتئين سولفيت ردوكتاز فلاووپروتئيني آلفا، توالي‌هاي 5SrRNA و درخت تاكسونومي براي 19 گونه انتخابي باكتريايي استخراج شد. سپس به مقايسه كمي درخت‌هاي فيلوژنتيكي توالي‌هاي 5SrRNA، ژن و پروتئين با يكديگر و با درخت تاكسونومي پرداخته شد. درخت‌هاي فيلوژنتيكي به كمك نرم‌افزار Mega7 و با استفاده از الگوريتم Neighbor joining رسم شد و درخت تاكسونومي با استفاده از Taxonomy Browser NCBI استخراج شد. نتايج: با مقايسه زوج درخت‌هاي مربوطه، درصد گونه‌هاي هم ارز و متوسط امتياز هم ارزي گونه‌ها در هر زوج درخت محاسبه شد. زوج درخت ژن-پروتئين بالاترين امتياز را در هر دو كميت به خود اختصاص داد. در مقايسه درخت تاكسونومي با سه درخت ديگر، زوج درخت ژنتاكسونومي بالاترين درصد را در متوسط امتياز هم ارزي به دست آورد و زوج درخت پروتئينتاكسونومي بالاترين درصد گونه‌هاي هم ارز را كسب كرد. نتيجه گيري: بر اساس پژوهش حاضر، مي‌توان دريافت كه مناسب‌ترين جايگزين براي هركدام از درخت‌هايي كه در اين پژوهش براي بررسي روابط تكاملي محاسبه شده است كدام است. به بيان ديگر، كدام درخت تكاملي را مي‌توان جايگزين درخت تكاملي ديگري كرد.