دسته‌بندي ژنتيكي ايزوله‌هاي اشريشياكلي O157:H7جدا شده از گوشت خام دام و طيور با روش RAPD-PCR

Genotyping of Escherichia coli O157: H7 strains isolated from raw ruminant and poultry meat samples by RAPD-PCR

باكتري اشريشياكلي O157:H7 يكي از مهم­ترين سويه­ هاي بيماري ­زاي روده­اي است كه معمولا از طريق آب و غذاي آلوده به انسان منتقل مي­ شود. اين سويه عامل ايجاد كوليت خونريزي­ دهنده، سندرم HUS، ترومبوتيك سيتوپنيك پورپورا و در مواردي مرگ است. مخزن اصلي اين باكتري نشخواركنندگان هستند. هدف از اين پژوهش دسته ­بندي ژنتيكي (ژنوتايپينگ) ايزوله ­هاي اين سويه جدا شده از گوشت خام دام و طيور با روش RAPD-PCR است. 344 نمونه گوشت خام نشخواركنندگان و طيور از مراكز عرضه گوشت تازه در شهرهاي اصفهان و شهركرد جمع ­آوري و پس از كشت و جداسازي اشريشياكلي از آن ها، حضور سروتيپ O157:H7 با استفاده از روش­ PCR تاييد شد. جهت دسته بندي ژنتيكي ايزوله هاي O157:H7 جدا شده از روش RAPD-PCR استفاده شد. از مجموع 344 نمونه گوشت خام مورد مطالعه، 202 جدايه اشريشياكلي (58/7درصد) جداسازي شد كه ميزان آلودگي به سويه O157:H7 در آن ها، 17/8 درصد (36 نمونه) بود.دسته بندي ژنتيكي جدايه­ هاي اشريشياكلي O157:H7، نه پروفايل مختلف را در ميان اين 36 جدايه نشان داد و قرابتي معادل 43/7 تا 100 درصد در بين ايزوله ها يافت شد. در اين پژوهش تشابه مولكولي زيادي بين سويه‌هاياشريشياكلي O157:H7 جدا شده از گوشت حيوانات مختلف در شهرهاي اصفهان و شهركرد ديده شد. همچنين مشخص شد كه روش RAPD-PCR روشي ساده، سريع و ارزان جهت توصيف تنوع ژنتيكي سويه ­هاي مختلف اشريشياكلي ازجمله سويه ­ O157:H7مي ­باشد.

Escherichia coli O157:H7 is one of the most important enteric pathogenic strains that is usually transmitted to humans through contaminated water and food. These strains cause hemorrhagic colitis, HUS syndrome, cytopenic purpura thrombosis, and, in some cases, death. The main repository of these bacteria is ruminants. The aim of this study was genetic classification (genotyping) of isolates of this strain isolated from raw meat and poultry by RAPD-PCR method. 344 samples of ruminants and poultry were collected from fresh meat supply centers in Isfahan and Shahrekord. Genetic classification of O157:H7 isolates was performed by the RAPD-PCR method. Of 344 raw meat samples studied, 202 Escherichia coli isolates (58.7%) were isolated. The rate of O157: H7 strain was 17.8% (36 samples). Genetic classification of Escherichia coli O157:H7 isolates showed 9 different profiles among these 36 isolates and found an affinity of 43.7 to 100% among the isolates. This study showed high molecular similarity between E. coli O157: H7 strains isolated from different animals in Isfahan and Shahrekord. It was also found that RAPD-PCR is a simple, fast, and inexpensive method for describing the genetic diversity of different E. coli strains including strain O157:H7.