همسانه‌سازي و بررسي بيوانفورماتيكي ژن CCD1 در زعفران(Crocus sativus L.) ايران

ايران بزرگترين توليدكننده زعفران جهان مي باشد بر همين اساس زعفران در كشور به عنوان يك محصول راهبردي محسوب مي‌گردد. از آنجا كه متابوليسم آپوكاروتنوئيدها عامل ارزش اقتصادي در گياه زعفران است، لذا جداسازي و تجزيه و تحليل شيميايي ژن‌هاي درگير در متابوليسم كاروتنوئيدها از اهميت ويژه‌اي برخوردار است. باتوجه به اهميت ژن در بيوسنتز آپوكاروتنوئيدها، در اين تحقيق به منظور شناخت بيشتر از ساختار ژنومي زعفران ايران، به بررسي ويژگي‌هاي فيزيكي و شيميايي اين ژن پرداخته شد. همچنين روابط فيلوژنتيكي آنزيم توسط سرورها و نرم‌افزارهاي بيوانفورماتيكي با هدف مطالعه پتانسيل ساختاري آن مورد پيش‌بيني قرار گرفت. ويژگي‌هاي فيزيكي و شيميايي و فيزيولوژي پروتئين توسط سرورها و ابزارهاي Protparam ، SOPMA، ProtScale ، Pfam ، ProtComp ، SignalP ، TMHMM ،، TargetP و ChloroP بررسي شدند. همچنين با استفاده از سرور ساختار سه‌بعدي پروتئين مورد بررسي قرار گرفت و جهت اعتبار سنجي ساختاري مدل ترسيم شده سه‌بعدي، پلات راماچاندران ترسيم گرديد. نتايج تجزيه و تحليل درخت فيلوژنتيكي نشان داد كه از لحاظ ساختار اسيد آمينه‌اي، پروتئين بيشترين قرابت را با داشت. نتايج تجزيه و تحليل ساختار پروتئين حاكي از فقدان وجود توالي راهنما و منطقه تراغشايي در آن بود و بطور كلي، نتايج نشان داد كه پروتئين ، آنزيمي از خانواده كاروتنوئيداكسيژنازها و پايدار در شرايط آزمايشگاهي است. تجزيه و تحليل‌هاي بيوانفورماتيكي انجام شده بر روي پروتئين زمينه را براي مطالعات عملكردي آينده فراهم مي‌كند.