تجزيه و تحليل مجموعه هاي ژني جهت شناسايي ژن ها و مسيرهاي زيستي مرتبط با صفات وزن بدن در مرغ

اين پژوهش به منظور مطالعه پويش كل ژنوم بر پايه تجزيه و تحليل غني سازي مجموعه ژني جهت شناسايي جايگاه هاي ژني مؤثر بر وزن بدن در سنين مختلف چهار نژاد مرغ چوآ، سيلك، لنگشن و بيرد با استفاده از آرايه هاي ژنومي با تراكم بالا انجام شد. اطلاعات ركوردهاي فنوتيپي و ژنوتيپي نمونه ها از پايگاه ذخيره ژنومي برخط Frontiersin استفاده شد. مطالعه پويش كل ژنومي از 402 قطعه مرغ و خروس با صفات وزن بدن از هفته اول تا 15 هفتگي در برنامه GenABEL ارزيابي شد. در مرحله بعد، تجزيه غني سازي مجموعه ژني با بسته نرم افزاري goseq برنامه R با هدف شناسايي عملكرد زيستي ژن هاي نزديك در مناطق انتخابي كانديدا با پايگاه هاي GO، KEGG، DAVID و PANTHER انجام شد. در اين پژوهش، تعداد 10 نشانگر تك نوكلئوتيدي واقع روي كروموزوم هاي 1، 2، 5، 7، 10، 14، 18، 19، 20 و 27 شناسايي شدند كه با ژن هاي ABCG1، MYOD1، MYH10، MYH11، MYO1B، MYO1C، MYO1E، MYL1، MYL2، MYL3، SLC2A8، ACACA، ACOX1، ACOX2 و PNPLA2 مرتبط بودند. برخي از اين ژن ها در مناطق معني دار با مطالعات قبلي هم خواني داشتند. در تجزيه غني سازي مجموعه ژني، تعداد 17 مسير هستي شناسي ژني و بيوشيميايي با صفات وزن بدن شناسايي شدند (01/0P˂). از اين بين، مسيرهاي cytoskeletal protein binding،anatomical structure development  و Tricarboxylic acid cycle نقش مهمي در توسعه الياف عضلاني اسكلتي و سوخت و ساز چربي داشتند. با توجه به تأييد مناطق قبلي پويش ژنومي صفات وزن بدن و شناسايي مناطق ژنومي جديد، استفاده از يافته هاي اين تحقيق مي تواند سبب تسريع در پيشرفت ژنتيكي برنامه هاي اصلاح نژادي مرغ شود.