با استفاده از (Malva neglecta) بررسي تنوع ژنتيكي در بين ژنوتيپهاي ايراني گياه پنيرك (SCoT) كدونهاي آغاز هدف واقع شده

(Genetic variation among Iranian genotypes of Malva (Malva neglecta) using Start codon targeted (SCoT

پنيرك از قديمي‌ترين گياهان دارويي مي‌باشد كه در طب كاربرد فراوان دارد. استخراج DNAبه روش CTAB براي 19 ژنوتيپ پنيرك از مناطق جغرافيايي مختلف ايران انجام گرفت و با استفاده از 15 نشانگر مولكولي SCoT تنوع ژنتيكي مورد بررسي قرار گرفت. نشانگر SCoT در بين ژنوتيپ‌‌ها چندشكلي مطلوبي نشان داد و اكثر آغازگرها براي بررسي‌هاي اين گونه مناسب بودند. آغازگرهاي SCoT در مجموع توانستند 83 باند توليد كنند، كه 76 باند چند شكل مشاهده شد. ميانگين تعداد باند توليد شده توسط هر آغازگر براي 19 ژنوتيپ برابر 36/4 بود كه آغازگرهاي SC36، SC11 و SC5 بيشترين تعداد باند (8) و آغازگرهاي SC26 و SC15 كمترين تعداد باند (3) را نشان دادند. نتايج نشان داد كه بيشترين تشابه را ژنوتيپ‌هاي 18G و 19G و كمترين تشابه را ژنوتيپ 15G با ژنوتيپ 3G داشتند. گروه‌بندي حاصل از تجزيه خوشه‌اي نشان داد كه ژنوتيپ‌ها در سه گروه قرار گرفته و تنوع ژنتيكي با تنوع جغرافيايي تطابق نداشت. نتايج حاصل از گروه‌بندي تجزيه خوشه-اي با استفاده از تجزيه واريانس مولكولي (AMOVA) تاييد گرديد.

Malva is one of the well-known medicinal and aromatic plants. The juice is one of the oldest herbs that is widely used in medicine. DNA extraction was carried out using CTAB method for 19 genotypes of different regions of Iran. Using SCoT molecular markers, genetic diversity was investigated. The SCoT marker showed favorable polymorphism among genotypes and most primers were suitable for this species. SCoT primers were able to produce 83 strips in total, with 76 multidimensional bands. The average number of bars produced by each primer for 19 genotypes was 4.36, with SC36, SC11 and SC5 primers having the highest number of bands (8), and the SC26 and SC15 primers showed the least number of bands (3). The results showed that the most similarities were genotypes G18 and G19 and the least similarity was genotypes G15 with G3 genotype. The cluster analysis showed that the genotypes were classified into three groups and genetic variation was not consistent with geographical variation. The results of cluster analysis were grouped using molecular variance analysis (AMOVA).