مطالعه تنوع ژنتيكي اكوتيپ‌هاي رازيانه با استفاده از نشانگر مولكولي ISSR

The study of genetic diversity in Foeniculum vulgare using ISSR molecular marker

يكي از قديمي‌ترين گياهان دارويي رازيانه (.Fueniculum vulgare Mill) مي‌باشد كه در طب سنتي كاربرد فراوان دارد. جهت تعيين ميزان تنوع ژنتيكي بين اكوتيپ‌هاي مختلف رازيانه اين تحقيق در دانشگاه پيام نور مركز كرمانشاه انجام گرفت. 16 اكوتيپ با استفاده از 15 آغازگرISSR مورد ارزيابي قرار گرفت. آغازگرهاي IS13 و IS10 به ترتيب با 10 و 9 باند بيشترين تعداد و آغازگر IS16 با 3 باند كمترين تعداد باند را تكثير نمودند. ميانگين درصد چند شكلي، محتواي اطلاعات چند شكلي (PIC)، شاخص نشانگري (MI) و شاخص نسبت چندگانه موثر (EMR) در بين اكوتيپ‌هاي مورد بررسي به ترتيب برابر 00/91%، 36/0، 83/1 و 98/4 بود. ميانگين شباهت ژنتيكي مشاهده شده براساس اطلاعات اين نشانگرها برابر 567/0 بود. بيشترين تشابه را اكوتيپ‌هاي (اردبيل 1) با (اردبيل 2) و (تهران 2) با (لرستان) (85/0) و كمترين تشابه را ژنوتيپ (بانك ژن 2) با (كرمانشاه) و (هرمزگان 3) (55/0) داشت. نتايج حاصل از گروه‌بندي تجزيه خوشه‌اي اكوتيپ‌‌ها را در3 گروه قرارداد كه اين نتيجه توسط تجزيه به مختصات اصلي تاييد گرديد.

Fennel (Foeniculum vulgare Mill.) is one of the well-known medicinal and aromatic plants. To determine variability between 16 Iranian Fennel ecotypes based on molecular markers, an experiment was carried out based on completely randomized design with three replications at Payame Noor University of Kermanshah, Iran, in 2014. Ecotypes were evaluated based on 15 ISSR primer markers. All of the ISSR primers showed 77 visible bands. The ISSR13 and ISSR10 primers had the most number of bands with 10 and 9 bands respectively. The mean polymorphic information content (PIC=0.36), marker index (MI= 1.83), Effective multiplex ratio (EMR= 4.98) and polymorphism percentage (91%) indices were calculated for all primers. Total genetic similarity based on these primers was 0.567 percent. Cluster analysis classified all ecotypes to three groups. This clustering was confirmed by principal coordinate (PCo) and analysis of molecular variance (AMOVA). Genotypes were evaluated based on 15 ISSR primer markers. All of the ISSR primers showed 77 visible bands. The ISSR13 and ISSR10 primers had the most number of bands with 10 and 9 bands respectively. The mean polymorphic information content (PIC=0.36), marker index (MI= 1.83), Effective multiplex ratio (EMR= 4.98) and polymorphism percentage (91%) indices were calculated for all primers. Total genetic similarity based on these primers was 0.567 percent.