شناسايي ژن‌هاي كليدي و مسيرهاي درگير در بيماري ويتيليگو ولگاريس با تجزيه و تحليل شبكه‌ي ژني

زمينه و هدف: ويتيليگو بيماري مزمن پوست و مو است كه با ازدست‌دادن ملانين مشخص مي شود و درصورت عدم درمان معمولاً پيشرونده و غيرقابل برگشت است. هدف از مطالعه‌ي حاضر شناسايي ژن هاي درگير در بيماري زايي ويتيليگو بود. روش اجرا: يك مجموعه‌ي داده‌ي بيان mRNA مرتبط با بيماري ويتيليگو با كد (GSE65127) از پايگاه داده ژنتيك عمومي (GEO) استخراج گرديد. ژن هاي افتراقي بيان‌شده توسط نرم افزار R مشخص گرديد. سپس شبكه‌ي ژني با استفاده از سايت STRING ترسيم و داده ها به‌نرم افزار CYTOSCAPE جهت تعيين صد ژن برتر منتقل گرديد. در پايان با استفاده از نرم افزار GEPHY شبكه‌ي ژني ترسيم و مسيرهاي متابوليكي ده ژن برتر با استفاده از سايت ENRICHR مورد تجزيه و تحليل قرار گرفت. يافته‌ها: در مقايسه با گروه كنترل، ده ژن برتري كه با بيان بيشتر به‌دست آمدند عبارتنداز TP53، HNRNPA2، SRSF1، PTEN، CDC42، EGFR، EIF4A1، MYB، HNRNPH1 و SF381 و ده ژن برتر با بيان كمتر نسبت به كنترل عبارتندازCDH2، LEP، KIT، GRIA2، SPP1، NRXN1، RUNX2، PDGFRB، NES و MYH11. مسيرهاي متابوليكي مرتبط با ژن‌هاي افزايش بيان‌يافته شامل Melanogenesis، Renin secretion و Pancreatic secretion و مسيرهاي متابوليكي مرتبط با ژن‌هاي كاهش بيان‌يافته شامل Prostate cancer، Epithelial cell signaling in helicobacter pylori infection و Melanoma هستند. نتيجه‌گيري:شناسايي ژن هاي افتراقي بيان‌شده در ويتيليگو مي تواند به درك ما از بيماري‌زايي آن كمك كند. هم چنين از اين ژن ها مي توان به عنوان اهداف دارويي براي درمان استفاده كرد.